主动离职时，保密协议是否有补偿主要取决于协议中是否包含竞业限制条款。以下是对这一问题的详细分析：

一、保密协议中无竞业限制条款的情况

1. 保密义务的性质：

   • 保密义务是劳动者的法定义务，即使保密协议中未约定补偿，劳动者在离职后仍需保守原用人单位的商业秘密。

2. 补偿情况：

   • 在此情况下，用人单位通常无需支付额外补偿。劳动者需持续保护原用人单位的商业秘密，不得擅自披露或使用。

二、保密协议中有竞业限制条款的情况

1. 竞业限制条款的法律基础：

   • 根据《中华人民共和国劳动合同法》第二十三条，用人单位可与劳动者在劳动合同或保密协议中约定竞业限制条款，并明确在劳动合同解除或终止后，于竞业限制期限内按月给予经济补偿。

2. 补偿标准与支付方式：

   • 补偿金标准通常为劳动者解除合同或终止合同前十二个月平均工资的30%，且不得低于劳动合同履行地的最低工资标准。
   • 补偿金应按月支付，确保劳动者在竞业限制期间得到应有的经济支持。

3. 未支付补偿金的法律后果：

   • 若用人单位未按约定支付经济补偿金，劳动者有权选择不履行保密协议中的竞业限制义务，并可要求用人单位支付应得的经济补偿金。此情况下，用人单位可能面临法律纠纷及赔偿风险。

三、实际操作中的建议

1. 审查协议内容：

   • 在签订保密协议时，劳动者应仔细审查协议内容，特别是关于竞业限制条款及补偿金的约定。确保协议内容明确、合法，并符合自身利益。

2. 保留相关证据：

   • 劳动者应保留与保密协议相关的所有证据，如协议文本、支付记录等。以便在发生争议时，能够证明自己的权益。

3. 及时维权：

   • 若用人单位未按约定支付补偿金，劳动者应及时通过法律途径维权。可以要求用人单位支付应得的经济补偿金，并可以寻求法律援助或咨询专业律师以获取更具体的法律建议。

总结来看，主动离职时保密协议是否有补偿，关键在于协议中是否包含竞业限制条款及用人单位的支付意愿。为避免潜在纠纷，建议双方在签订保密协议时明确竞业限制条款的具体内容，包括补偿金的标准、支付方式及期限等。如果您在保密协议或劳动纠纷方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。