结论：能否办理入住需结合公司规定性质、员工手册合法性及员工个人情况综合判断。以下为具体分析：

1. 公司规定是否具有法律效力

• 若公司规定合法且合理：公司有权根据内部管理需要制定差旅或住宿标准（如限高星级酒店），但需满足以下条件：
  • 规定不违反《劳动合同法》《就业促进法》等强制性法律法规；
  • 规定已通过民主程序（如职工代表大会讨论）并公示告知员工；
  • 规定不涉及歧视性条款（如仅针对特定员工群体）。
• 若公司规定违法或不合理：例如规定超出法定管理权限（如要求员工承担超额费用），或未履行民主程序，则员工有权拒绝执行，并可主张权益。

2. 员工手册或劳动合同的约定

• 若劳动合同或员工手册明确约定住宿标准：员工需遵守约定，否则可能构成违约（如公司有权拒绝报销超额部分费用）。
• 若未明确约定：公司单方面限制住宿标准可能缺乏依据，员工可主张按实际需求选择酒店，但需保留相关费用凭证以备报销。

3. 实际操作中的注意事项

• 费用承担主体：若公司承担住宿费用，其有权设定合理标准；若员工自行承担，公司无权干涉。
• 特殊情况处理：如因工作需要（如接待重要客户）需入住更高标准酒店，员工可提前与公司协商并取得书面同意。
• 证据保留：建议员工保留公司规定文件、沟通记录及费用凭证，以备争议时举证。

4. 法律风险提示

• 若公司以“违反规定”为由处罚员工（如扣减工资、解除合同），需审查处罚依据是否合法。根据《劳动合同法》，公司规章制度需同时满足“内容合法”“程序合法”“公示告知”三要件，否则处罚可能被认定为违法。

建议：

1. 查阅劳动合同、员工手册中关于差旅住宿的条款；
   
2. 与公司HR或上级沟通，明确规定背景及执行依据；
   
3. 若认为规定不合理，可向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
   

如有进一步疑问，可直接向我咨询具体法律问题。