您好，关于您提出的“不在一个户口本上可以做亲子鉴定么”的问题，我可以给您一个清晰且详细的解答。

不在一个户口本上，完全可以做亲子鉴定。亲子鉴定是一种通过科学手段来确定亲子关系的方法，它并不依赖于户口本上的记录。无论是个人亲子鉴定还是司法亲子鉴定，其核心目的都是通过分析DNA等生物遗传信息来确认亲子关系，因此户口本的情况并不会影响鉴定的进行。

具体来说，亲子鉴定分为个人亲子鉴定和司法亲子鉴定两种类型：

1. 个人亲子鉴定：这种鉴定通常用于个人了解亲子关系，不涉及法律程序。您可以自行选择鉴定机构，并按照机构的要求提供样本（如血痕、毛发、口腔黏膜等）进行鉴定。鉴定结果仅供个人参考，不具有法律效力。

2. 司法亲子鉴定：这种鉴定通常用于法律程序，如户口迁移、继承权确认等。在进行司法亲子鉴定时，您需要选择具有司法鉴定资质的机构，并按照机构的要求提供样本和身份证明等文件。鉴定结果具有法律效力，可以作为法律程序的依据。

对于您提到的户口不在一个户口本上的情况，无论是个人亲子鉴定还是司法亲子鉴定，都不会因此受到影响。您只需要按照鉴定机构的要求提供相应的样本和文件即可。

此外，如果您需要进行司法亲子鉴定以作为母子关系证明（例如户口迁移等情况），除了亲子鉴定意见书外，您还可以考虑提供其他父母子女关系认定材料，如出生医学证明、公证机关出具的亲子关系公证书、申请人户籍地派出所出具的亲子关系证明等。这些材料都可以作为辅助证明，帮助您顺利完成相关手续。

最后，我建议您在选择亲子鉴定机构时，一定要选择具有正规资质和良好信誉的机构，以确保鉴定结果的准确性和可靠性。如果您有任何疑问或需要进一步的帮助，请随时联系专业的亲子鉴定机构或相关部门进行咨询。