民政旗下单位借款是否合法，需结合具体情况判断，但通常合法性取决于借款主体、借款用途及程序合规性。以下从不同角度为您详细分析：

1. 借款主体合法性

• 民政旗下单位性质：若该单位为依法设立的法人（如事业单位、社会团体等），且具备独立承担民事责任的能力，则其借款行为在主体上通常合法。
• 例外情形：若单位无独立法人资格，或借款行为超出其经营范围（如非营利性单位从事营利性借贷），则可能涉嫌违法。

2. 借款用途合法性

• 合法用途：借款用于单位正常运营、公益项目或法定职责范围内的支出（如救灾、扶贫等），通常合法。
• 非法用途：若借款用于非法活动（如赌博、洗钱）或个人挥霍，则不仅借款行为违法，还可能涉及刑事犯罪。

3. 程序合规性

• 内部审批：借款需经单位内部合法程序审批（如董事会决议、上级主管部门批准等），否则可能因程序瑕疵导致合同无效。
• 公开透明：借款过程需公开透明，避免利益输送或暗箱操作，否则可能引发行政责任或民事纠纷。

4. 法律后果

• 合法借款：若符合上述条件，借款合同有效，双方需按约定履行义务，否则需承担违约责任。
• 违法借款：若借款主体、用途或程序违法，合同可能被认定无效，借款人需返还借款，并可能面临行政处罚或刑事责任。

5. 实务建议

• 核查资质：借款前核查单位法人资格、经营范围及信用记录。
• 明确用途：在合同中明确借款用途，并保留相关凭证。
• 完善程序：确保借款经合法程序审批，并留存书面记录。
• 咨询律师：若涉及大额借款或复杂交易，建议提前咨询专业律师，规避法律风险。

总结：民政旗下单位借款是否合法，需综合判断主体、用途及程序。若您遇到具体纠纷，可直接向我咨询，我将结合案情为您提供专业法律意见。