在交通事故中，当机动车承担次要责任，非机动车承担主要责任时，赔偿问题通常依据《道路交通安全法》《民法典》及相关司法解释来处理。以下是对此情况赔偿问题的详细解答：
一、责任划分
在机动车与非机动车的事故中，即使非机动车负主要责任，考虑到非机动车相对机动车是弱势方，机动车一方通常仍需承担一定比例的赔偿责任。具体来说，若非机动车负主要责任，机动车可能需承担40%~60%的赔偿责任，具体比例会根据双方的过错程度、事故具体情况等因素来综合确定。
二、赔偿项目与计算
赔偿范围通常包括直接损失和合理的间接损失，具体项目如下：
人身损害赔偿：
- 医疗费：根据实际发生的医疗费用进行报销，包括后续治疗费用。
- 误工费：根据受害人实际减少的收入计算，需要提供相应的收入证明。
- 护理费：根据护理人员的收入或市场护工标准来确定。
- 交通费、营养费：根据合理支出并提供相应的凭证。
- 残疾/死亡赔偿金：根据当地人均可支配收入计算，残疾按伤残等级，死亡按一定年限（如20年）的标准来赔偿。
- 精神损害赔偿：根据责任比例和损害后果来酌情确定。
财产损失赔偿：
- 包括车辆维修费、物品损失费、施救费等。若车辆全损，则按实际价值折旧赔偿。
三、保险赔付流程
交强险优先赔付：
- 责任方投保的交强险需在限额内不分责任先行赔付。具体限额包括：医疗费用限额（如18,000元）、死亡伤残限额（如180,000元）、财产损失限额（如2,000元）。
- 超出交强险限额的部分，再按责任比例由商业三者险或责任人承担。
商业险按比例赔偿：
- 交强险赔付后，剩余部分由责任方的商业三者险按责任比例进行赔偿。
- 若未投保商业险，则由责任人自行承担对应比例的赔偿责任。
四、处理流程与注意事项
协商与诉讼：
- 双方可尝试协商赔偿比例，但不得低于法定最低标准。
- 若协商不成，可向法院提起诉讼，法院将结合证据、过错程度等因素进行判决。
特殊情况处理：
- 若非机动车方故意造成事故（如碰瓷），机动车方可能不承担责任。
- 若涉及酒驾、逃逸等违法行为，保险公司可能拒赔商业险部分。
诉讼时效：
- 人身损害赔偿的诉讼时效通常为3年，自事故发生时起算。
五、示例说明
假设机动车（次责30%）与非机动车（主责70%）发生事故，非机动车方损失总计10万元，机动车方交强险限额为8万元。那么：
- 交强险赔付：8万元（不划分责任比例）。
- 剩余部分：2万元，按责任比例分摊，机动车方需承担2万元 × 30% = 0.6万元作为额外补偿。
- 非机动车方自行承担：2万元 × 70% = 1.4万元。
综上所述，在机动车次要责任与非机动车主要责任的交通事故中，赔偿问题涉及多个方面，包括责任划分、赔偿项目与计算、保险赔付流程以及处理流程与注意事项等。双方应依法进行协商或诉讼，以确保赔偿问题得到妥善处理。