针对您提出的“红灯时后轮过了停止线停车怎么处罚”的问题，以下是根据相关法律法规进行的详细解答：

一、一般情况下的处理

当红灯亮起时，如果车辆的后轮过了停止线但立即停住，并未继续前行，这通常被视为“越线停车”而非“闯红灯”。根据《中华人民共和国道路交通安全法实施条例》第五十一条的规定，机动车遇停止信号时应停在停止线以外。若车辆在红灯亮起时只是后轮刚刚越过停止线，并且紧接着就停住了，没有形成“继续行驶”的事实，那么交管部门一般不会对其进行处罚。

然而，需要注意的是，尽管这种情况下通常不被处罚，但驾驶员仍应高度警惕，确保在行驶过程中严格遵守交通规则，避免类似情况的发生。

二、可能被视为违章的情况

如果车辆在红灯亮起时后轮越过停止线后，有明显的位置移动或继续前行，甚至完成了驶过停止线、到达路中间、到达对面路口的三个阶段，那么这种行为将被明确认定为“闯红灯”。根据《中华人民共和国道路交通安全法》第九十条的规定，闯红灯是违反道路交通安全法律、法规的行为，将处警告或者二十元以上二百元以下罚款，并扣6分。

三、特殊情况的处理

在某些特殊情况下，如驾驶员为紧急避让突然出现的行人、非机动车或其他障碍物等不可抗力因素，导致后轮压到停止线，并且能提供充分的证据（如行车记录仪视频）证明这一行为是出于安全考虑，那么可以向交通管理部门提出申诉。交警部门会根据实际情况进行判断和处理，有可能会免于处罚。

四、总结与建议

综上所述，红灯时后轮过了停止线停车的处罚情况取决于车辆的具体行为以及是否存在特殊情况。驾驶员在行驶过程中应严格遵守交通规则，注意观察信号灯和停车线的位置，确保行车安全。如果不慎越线，应立即停止行驶，并根据实际情况判断是否需要向交通管理部门说明情况或提出申诉。同时，也建议驾驶员在车辆上安装行车记录仪等设备，以便在必要时提供充分的证据来维护自己的合法权益。