当电动车在交通事故中负有主要责任时，赔偿机动车的损失需要遵循一系列明确的步骤和法律规定。以下是对这一问题的详细解答：
一、明确损失范围
首先，需要明确因事故造成的所有损失，包括但不限于机动车的车辆维修费用、因事故产生的合理施救费用，以及如果有机动车上人员受伤所产生的医疗费用、误工费、护理费等。这些都是在赔偿时需要考虑的因素。
二、确定赔偿途径
保险赔偿：
- 如果电动车投保了相关保险（如交强险或第三者责任险），那么赔偿应首先由保险公司在责任限额范围内进行。
- 超出保险限额的部分，则按照责任划分，由电动车一方承担主要赔偿责任。一般来说，主要责任方承担的赔偿比例在70%-90%之间，具体比例需根据实际情况和当地司法实践来确定。
无保险赔偿：
- 如果电动车未投保任何保险，那么所有损失（超出交强险限额部分）将直接由电动车一方按责任比例进行赔偿。
三、赔偿流程
报警与责任认定：
- 事故发生后，双方应立即报警，由交警部门进行现场勘查并出具事故责任认定书，这是后续赔偿的重要依据。
协商赔偿：
- 在责任明确后，双方应就赔偿问题进行协商。电动车一方应主动沟通，并合理确定赔偿金额和支付方式。
- 如果协商达成一致，可以签订赔偿协议并履行。
保险理赔（如有）：
- 如果电动车投保了保险，应及时向保险公司报案，并按照要求提供相关材料申请理赔。
诉讼解决：
- 如果协商不成，机动车一方可以收集相关证据（如事故认定书、维修发票、医疗单据等），向人民法院提起民事诉讼。
- 法院将依法审理案件，并作出判决，要求电动车一方承担相应的赔偿责任。
四、专业建议
在处理此类事故赔偿问题时，建议双方当事人都寻求专业法律人士的帮助，以确保自己的权益得到妥善保护。同时，也应积极配合交警部门的调查和处理工作，以便更好地解决事故纠纷。
综上所述，当电动车在交通事故中负有主要责任时，赔偿机动车的损失需要明确损失范围、确定赔偿途径、遵循赔偿流程，并在必要时寻求专业法律帮助。这样才能确保赔偿过程的公正、合理和合法。