结论前置：在建设工程竣工验收过程中，若消防查验报告不存在却办理了消防验收意见书，这一行为通常是不合法的，可能涉及违反相关法律法规和程序规定。
一、法律法规依据
根据《中华人民共和国消防法》以及《建设工程消防设计审查验收管理暂行规定》等相关法律法规，建设工程在竣工验收时，必须确保消防设施符合消防安全要求，并提交相应的消防查验报告。消防查验报告是证明建设工程消防安全符合要求的重要文件，是办理消防验收意见书的前提条件之一。
二、合法性分析
程序合法性：从程序上看，消防查验报告是办理消防验收意见书的必要环节。若未进行消防查验或查验报告不存在，却办理了消防验收意见书，这明显违反了法定程序，因此是不合法的。
实体合法性：从实体上看，消防查验报告是对建设工程消防安全状况的全面评估。若未进行查验或查验报告不真实，那么消防验收意见书所依据的基础就不牢固，可能导致消防安全存在隐患。这种实体上的不合法性同样不容忽视。
三、可能后果
行政处罚：对于未按规定进行消防查验或提交虚假查验报告的行为，相关部门有权依法进行行政处罚，包括罚款、责令整改等。
法律责任：若因消防安全存在隐患而导致火灾等事故发生，相关责任人可能面临刑事责任或民事责任的追究。
影响工程使用：未通过合法消防验收的建设工程，可能无法投入使用或面临停工整改的风险。
四、建议与措施
立即整改：若发现消防查验报告不存在却已办理消防验收意见书的情况，应立即向相关部门报告并申请整改。
补全手续：按照法律法规要求，补全消防查验报告等必要手续，确保消防验收意见书的合法性和有效性。
加强监管：相关部门应加强对建设工程消防验收的监管力度，确保消防查验报告的真实性和完整性。
总结：在建设工程竣工验收过程中，消防查验报告是办理消防验收意见书的重要前提。若查验报告不存在却办理了消防验收意见书，这一行为通常是不合法的。为确保消防安全，相关责任人应严格遵守法律法规要求，确保消防查验报告的真实性和完整性。若您在此方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。