针对您提出的“同一段在高速上应急车道被抓拍两次以上怎么处罚”的问题，以下是我为您提供的详细解答：
首先，需要明确的是，无论被抓拍多少次，只要是非紧急情况下占用应急车道行驶，都将面临罚款和记分的处罚。这是为了维护高速公路的通行秩序和应急车道的正常使用。
一、罚款处罚
一般情况：根据《中华人民共和国道路交通安全法》第九十条及其实施条例，非紧急情况占用应急车道，将处以20元以上200元以下的罚款。这一处罚标准适用于大多数非紧急情况下的占用行为。
多次抓拍：如果您在同一段高速上应急车道被多次抓拍，每次抓拍都将视为一次独立的违法行为，因此每次都将面临相同的罚款处罚。也就是说，如果您被抓拍两次，那么您将需要支付两次罚款，罚款总额将是单次罚款的两倍。
二、记分处罚
普通车辆：根据《机动车驾驶证申领和使用规定》，驾驶机动车在高速公路或城市快速路上违法占用应急车道行驶的，一次记6分。这意味着，无论您被抓拍多少次，每次都将被记6分。如果您在短时间内多次被抓拍，您的驾驶证记分可能会迅速累积，甚至达到或超过12分，从而面临更严重的处罚，如吊销驾驶证等。
运营车辆：对于大货车、危险品运输车等运营车辆，违法占用应急车道的后果更为严重。一次将记12分，并对驾照进行降级处理。这体现了对专业驾驶员更高标准的要求。
三、处罚的执行与后续
公安机关交通管理部门将依法实施罚款的行政处罚，并要求驾驶人在收到处罚决定书后15日内到指定银行缴纳罚款。逾期不缴纳的，将按日加收3%的滞纳金。对于多次被抓拍的驾驶人，需要分别处理每次的处罚决定书，并按时缴纳每次的罚款。
四、特殊情况下的免责
当然，也存在一些特殊情况下的免责情形。例如，如果机动车发生交通事故或故障确需停车等待救援等紧急情况，可以在应急车道内临时停放，此时不会被处罚。但应持续开启危险报警闪光灯，并在来车方向150米以外设置警告标志，车上人员应迅速转移到安全区域，并立即报警。
五、总结与建议
综上所述，同一段在高速上应急车道被抓拍两次以上，每次都将面临罚款和记分的处罚。因此，我建议您在行车过程中严格遵守交通规则，避免随意占用应急车道。在遇到紧急情况时，也应按照法律规定正确使用应急车道，确保自身和他人的安全。同时，也建议您定期查询自己的驾驶证记分情况，避免因记分累积过多而面临更严重的处罚。