未满十六岁骑电动车行政违法三年后，相关违法记录并不会自动彻底删除。以下是对此问题的详细分析：
一、行政违法记录的性质与处理
行政违法记录是行政机关对违法行为人进行处罚后所形成的记录，它反映了违法行为人的违法事实和行政机关的处理结果。这类记录通常会被保存在行政机关的档案中，以备后续查询和管理。对于行政违法记录，并没有明确的法律规定其会在一定年限后自动删除。这意味着，一旦形成行政违法记录，它可能会长期存在，除非有特定的法律程序或规定要求删除。
二、未成年人违法记录的特殊处理
虽然未成年人违法记录在处理上可能会考虑到其年龄和心智发展不成熟的因素，但这并不意味着其违法记录会自动删除。未成年人违法后，行政机关会根据其违法情节和后果进行相应的处罚，并形成违法记录。这些记录同样会被保存在行政机关的档案中。
三、违法记录删除的可能途径
法律程序申请删除：在某些特定情况下，如违法行为人已经接受了相应的处罚并改正了错误，或者违法记录的存在对其造成了不合理的困扰，可以尝试通过法律程序申请删除违法记录。但这通常需要满足一定的条件，并经过行政机关的审查和批准。
档案销毁规定：根据档案管理规定，某些档案在达到一定保存年限后可能会被销毁。然而，这并不意味着所有违法记录都会因此被删除。档案的销毁通常受到严格的程序和规定限制，且并非所有档案都会被销毁。
四、对未成年人的建议
对于未满十六岁的未成年人来说，骑电动车违反交通规定是一种不负责任且危险的行为。它不仅可能对自己造成伤害，还可能对他人造成威胁。因此，我建议：
遵守交通规定：无论年龄大小，都应该严格遵守交通规定，确保自己和他人的安全。
增强法律意识：了解并遵守相关法律法规，避免因为无知或疏忽而违法。
积极改正错误：如果已经违法并受到了处罚，应该积极改正错误，避免再次违法。
如果有任何关于法律方面的问题或疑虑，可以直接向我咨询。我会根据你的具体情况提供专业的法律建议和帮助。