银行卡逾期后，冻结银行卡的部门通常是发卡银行本身，但在特定情况下，司法机关或行政机关也可能介入冻结。具体分析如下：

1. 银行自主冻结
   当银行卡出现逾期还款时，发卡银行有权根据合同约定对账户进行冻结。这是银行基于风险控制的需要，防止逾期金额进一步扩大。冻结后，持卡人将无法使用该卡进行交易，但账户内的余额仍会用于抵扣逾期欠款及相关费用。

2. 司法机关冻结
   如果银行通过法律途径追讨欠款（如起诉持卡人），在诉讼过程中，法院可能根据银行的申请对持卡人的银行账户进行冻结。这种冻结属于司法强制措施，目的是保障判决的执行。此外，如果持卡人因其他违法行为（如涉嫌诈骗）被公安机关立案调查，公安机关也可能依法冻结其银行账户。

3. 行政机关冻结
   在极少数情况下，行政机关（如税务机关、海关）可能因持卡人涉及税务违法、走私等行为，依法对其银行账户进行冻结。但这种情况与银行卡逾期无直接关联，更多是因其他违法行为引发。

建议：

• 若因逾期被银行冻结，应尽快与银行沟通还款计划，争取解冻。
  
• 若因司法或行政机关冻结，需配合相关调查，并咨询律师了解具体法律程序。
  

如有进一步疑问，可直接向我咨询，我会结合具体情况为您提供详细解答。