结论：网贷未申请结清证明就注销账户，可能存在一定后遗症，但具体影响需结合实际情况判断。以下从不同角度为您详细分析。

一、可能存在的后遗症及法律分析

1. 债务纠纷风险
   若未取得结清证明，网贷平台可能主张您仍有未清偿债务，尤其在系统记录不完整或存在技术故障时。根据《民法典》第六百七十五条，借款人应按约定期限返还借款，若平台能提供有效证据（如电子合同、还款记录），您可能面临被追偿的风险。
   建议：立即联系平台补开结清证明，并保留所有还款凭证（如银行流水、支付记录）。

2. 信用记录影响
   若平台未及时更新您的还款状态至征信系统，可能导致征信报告显示“未结清”或“逾期”。根据《征信业管理条例》第十六条，征信机构对个人不良信息的保存期限为5年，但若信息错误，您有权要求更正。
   建议：定期查询个人征信报告（可通过中国人民银行征信中心官网），发现错误后及时向平台或征信机构提出异议。

3. 法律程序风险
   若平台因系统错误或内部管理问题，误认为您未还款，可能通过诉讼或仲裁追讨债务。此时，您需承担举证责任，证明债务已清偿。
   建议：保存所有与平台的沟通记录（如邮件、短信、聊天记录），作为后续维权证据。

二、如何降低后遗症风险？

1. 主动补开结清证明
   即使账户已注销，仍可联系平台客服要求出具结清证明。根据《电子签名法》第三条，电子合同与纸质合同具有同等法律效力，平台有义务提供还款确认文件。

2. 留存还款证据
   若无法补开证明，需整理所有还款凭证，包括：

   • 银行转账记录（注明“网贷还款”）；
     
   • 第三方支付平台交易明细；
     
   • 平台发送的还款成功通知（截图或邮件）。

3. 监控信用状态
   建议每年至少查询一次征信报告，重点关注“贷款记录”和“逾期记录”部分。若发现异常，可依据《征信业管理条例》第二十五条，向征信机构或信息提供者提出书面异议。

三、特殊情况处理

1. 平台已注销或失联
   若平台因经营不善退出市场，您可通过以下途径维权：

   • 向当地金融监管部门投诉（如银保监会）；
     
   • 联系平台存管银行查询资金流向；
     
   • 委托律师通过法律程序确认债务消灭。

2. 涉及刑事风险
   若平台以“未结清”为由实施诈骗（如伪造债务、威胁曝光隐私），可能涉嫌敲诈勒索罪。根据《刑法》第二百七十四条，您可向公安机关报案。

四、总结与建议

1. 立即行动：优先联系平台补开结清证明，避免拖延导致证据灭失。
2. 全面取证：整理所有还款记录，形成完整证据链。
3. 定期自查：通过征信报告监控信用状态，防范潜在风险。
4. 法律维权：若遇平台不当行为，及时咨询律师或通过监管渠道投诉。

如有进一步疑问（如具体操作流程、证据整理要点），可直接向我咨询，我将结合您的实际情况提供针对性建议。