宅基地房屋被他人侵占，其诉讼时效问题需分情况讨论：
物权保护角度：
- 从物权保护的角度来看，宅基地使用权属于用益物权，物权本身不存在诉讼时效的限制。这意味着，只要侵占行为持续存在，权利人随时都可以主张自己的权利，不受诉讼时效的约束。例如，如果您的宅基地一直被他人非法占用，您可以在任何时候要求对方停止侵占并返还宅基地。
债权请求权角度：
- 如果涉及因侵权行为而产生的损害赔偿等债权请求权，那么就需要适用诉讼时效的规定。根据我国法律规定，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年，从权利人能察觉到或应察觉到权利受损害且知道义务人时开始计算。若法律另有规定，则按规定执行。例如，如果因为宅基地被侵占而导致了您的财产损失，您需要在知道或应当知道损失发生之日起三年内提起诉讼，要求对方赔偿损失。
- 计算公式（若涉及赔偿）：
- 赔偿金额 = 实际损失金额（需有证据支持）
- 诉讼时效期间 = 3年（从知道或应当知道权利受损害且知道义务人时开始计算）
- 需要注意的是，如果自权利受到损害之日起超过二十年，人民法院一般不予保护。但是，如果有特殊情况，人民法院可以根据权利人的申请来决定是否延长诉讼时效。
法律建议：
- 及时收集证据：无论从哪个角度考虑，及时收集和保存相关证据都是至关重要的。这包括宅基地的权属证明（如宅基地使用证）、侵占行为的证据（如现场照片、视频、证人证言）以及因侵占行为而产生的损失证据（如维修发票、购买凭证等）。
- 及时主张权利：如果发现宅基地被他人侵占，应尽快与对方协商解决。如果协商无果，可以向乡镇人民政府或县级以上人民政府申请处理。如果对处理决定不满意，可以在规定期限内提起行政复议或行政诉讼。
- 注意诉讼时效：如果涉及损害赔偿等债权请求权，务必注意诉讼时效的限制。在知道或应当知道权利受损害且知道义务人时，应尽快提起诉讼，以免因超过诉讼时效而丧失胜诉权。
可能后果：
- 如果超过诉讼时效才提起诉讼，对方可能会以时效已过为由进行抗辩，导致您的诉求得不到法院的支持。
- 如果未能及时收集证据或主张权利，可能会在后续的法律程序中处于不利地位。
总结与引导：
宅基地房屋被他人侵占的诉讼时效问题需根据具体情况来判断。从物权保护的角度来看，不受诉讼时效的限制；但从债权请求权的角度来看，则需要适用三年的诉讼时效规定。因此，在处理此类纠纷时，务必及时收集证据、主张权利，并注意诉讼时效的限制。如果您有任何法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。