针对您提出的“摩托车司机被小车撞了怎么赔偿”的问题，这是一个涉及交通事故责任认定与赔偿流程的重要事项。以下是我为您整理的详细解答：
一、明确事故责任主体
首先，需要明确的是交通事故的责任主体。这通常由交警部门根据现场勘查、证人证言、监控录像等证据来裁定。如果裁定小车全责，那么小车车主或其保险公司需要承担全额赔付责任；如果摩托车司机也有责任，那么赔偿将按照双方所承担的责任比例进行合理分配。
二、评估摩托车损害
接下来，需要对摩托车所受到的损害进行评估。这包括摩托车的修复费用或替换部件的费用。这些费用应由保险公司（如果小车有投保）或责任方（小车车主）承担。在评估过程中，建议保留好相关的维修发票或替换部件的购买凭证，以便后续索赔。
三、核定医疗费用及相关开支
如果摩托车司机在事故中受伤，那么还需要核定其所需的医疗费用、住院费、康复费等。这些费用同样需要纳入赔偿范畴。在就医过程中，建议保留好详细的病历、发票等医疗凭证，以便后续索赔。
四、考虑残疾赔偿或死亡抚恤金
更为严重的是，如果因事故导致摩托车司机致残或不幸身亡，那么还需要承担相应的残疾赔偿或死亡抚恤金给付责任。这部分赔偿通常根据受害人的伤残等级或死亡情况来确定，并会涉及到较高的赔偿金额。
五、法律途径与诉讼时效
如果与对方车主或其保险公司协商赔偿事宜无法达成一致，那么可以向法院提起诉讼。在诉讼过程中，务必准备好事故责任认定书、医疗凭证、收入证明等相关证据，以确保自己的诉求能够得到支持。同时，要注意诉讼时效的问题。一般来说，人身损害赔偿的诉讼时效是三年，从知道或者应当知道自己的权利被侵害之日起开始计算。
六、保险赔偿与责任方承担
如果对方车辆购买了交强险和商业险，那么首先应该由保险公司在保险责任的范围内进行赔偿。超出保险责任范围的部分，则由责任方（小车车主）来承担。
七、建议与注意事项
综上所述，摩托车司机被小车撞了后的赔偿流程涉及多个方面，包括明确事故责任主体、评估摩托车损害、核定医疗费用及相关开支、考虑残疾赔偿或死亡抚恤金、法律途径与诉讼时效、保险赔偿与责任方承担等。希望这些信息能对您有所帮助，并在处理此类事故时提供清晰的指导。