您好，关于车辆商业险在营运中发生事故的赔偿问题，这是一个涉及法律条款和保险合同细节的复杂问题。以下是我为您整理的详细解答：

一、赔偿依据与原则

营运车发生事故后的赔偿，主要依据《民法典》和《道路交通安全法》等相关法律法规。赔偿的原则是先确定事故责任，然后根据责任比例和保险合同条款进行赔偿。

二、赔偿步骤与流程

1. 确定事故责任：

   • 交通事故责任认定是赔偿的基础。交管部门会根据当事人的行为对事故发生的作用及过错严重程度，划分责任，如全部责任、主要责任、同等责任、次要责任或无责任。

2. 交强险赔偿：

   • 如果营运车在事故中无责任，对方车辆的交强险将在限额内赔偿您的损失。
   • 如果营运车在事故中有责任，您的交强险将首先赔偿对方的人身伤亡和财产损失。

3. 商业险赔偿：

   • 超出交强险限额的部分，如果营运车投保了商业险（如商业三者险），则由商业险按照保险合同的约定进行赔偿。
   • 商业险的赔偿比例和限额将根据保险合同的具体条款来确定。

4. 责任人赔偿：

   • 如果交强险和商业险的赔偿仍然不足，或者营运车没有投保商业险，那么超出部分将由责任人（如司机或车主）根据事故责任比例进行赔偿。

三、特殊赔偿项目

1. 停运损失：

   • 如果事故导致营运车停运，您可以根据实际停运时间和营运收入减少情况主张赔偿。这需要您提供相关证据来证明营运收入和停运时间。

2. 车上人员伤亡赔偿：

   • 如果事故导致车上人员伤亡，赔偿将按照法律规定和保险合同处理。这可能包括医疗费、误工费、护理费、伤残赔偿金等。

四、法律责任界定

• 如果事故是营运车一方过错导致，司机或车主通常要承担责任。如果司机是受雇于公司，且属于职务行为，那么营运公司应承担赔偿责任。如果司机有故意或重大过失，公司赔偿后可以向司机追偿。
• 如果涉及多方责任，赔偿将按责任比例分担。

五、建议与注意事项

• 在处理事故赔偿时，建议您保留好所有相关证据，如事故现场照片、交警出具的事故责任认定书、医疗费用发票等。
• 如果您对赔偿流程或法律条款有疑问，建议咨询专业的法律人士或保险代理人，以确保您的权益得到妥善保障。

综上所述，车辆商业险在营运中发生事故的赔偿是一个涉及多个方面的复杂问题。希望以上解答能够帮助您更好地理解赔偿流程和原则，并在处理事故时维护自己的合法权益。