撤案一般不会留下案底，但具体情况需根据案件性质、撤案阶段及原因综合判断。以下是对此问题的详细分析：
一、不构成犯罪的撤案
侦查阶段撤案：
- 在侦查过程中，若公安机关或其他侦查机关发现不应对犯罪嫌疑人追究刑事责任的，如案件属于误会、所谓的“犯罪行为”实际并未发生，或犯罪嫌疑人的行为情节显著轻微、危害不大且不认为是犯罪，应当撤销案件。
- 此情况下，因未认定犯罪嫌疑人构成犯罪，故不会留下案底。
审查起诉阶段撤案：
- 检察机关在审查起诉时，若发现犯罪嫌疑人没有犯罪事实，或存在《刑事诉讼法》第十六条规定的情形（如情节显著轻微、危害不大；犯罪已过追诉时效期限等），应作出不起诉决定。
- 对于犯罪情节轻微，依照刑法规定不需要判处刑罚或免除刑罚的，检察院也可作出不起诉决定。这两种不起诉决定均意味着犯罪嫌疑人不会被交付审判，因此不会有犯罪记录，即不会留下案底。但需注意，若是检察院作出的酌定不起诉决定，其不起诉决定书会存入个人档案，可能视为一种特殊记录，不过这并不等同于通常意义上的“案底”。
二、构成犯罪但特殊情况撤案
- 在某些特定的自诉案件中，若被害人与被告人达成和解协议，被害人主动撤回起诉，且犯罪事实确实存在，只是基于被害人的意愿而撤案，严格来说行为人的行为依然构成犯罪。
- 但由于没有经过法院的有罪判决，从通常所理解的“案底”（即犯罪记录）角度，可能不会在官方的犯罪记录档案中留下记录。然而，司法机关处理案件过程中形成的相关材料可能会有留存。
三、存在特殊记录的情况
- 即使案件撤案没有犯罪记录，但在案件办理过程中，若发现有相关的行政违法行为并给予了行政处罚（如罚款、行政拘留等），则会留下行政处罚的记录。
- 这种记录虽不同于犯罪案底，但也属于一种不良记录，可能对个人的未来产生一定影响，例如在求职、升学或参与某些特定社会活动时，可能会受到一定的限制或影响。
四、撤案后的内部记录
- 撤案后，在公安机关或交警部门内部可能会有相应的事件记录。这些记录主要是为了内部管理和案件统计的需要，它们并不等同于刑事案底，也不会对外公开或影响个人的社会评价。
- 这些内部记录的存在，有助于公安机关更好地了解案件情况，优化案件管理流程，但并不对涉案人员的日常生活和工作产生实质影响。
建议：
- 如果您或您身边的人遇到了撤案的情况，不必过于担心会留下案底。但也要注意，撤案并不意味着完全没有记录，特别是在涉及行政违法行为的情况下。
- 在处理任何法律问题时，都应确保自己的行为合法合规，避免陷入不必要的法律纠纷。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供专业的法律建议。