企业实际经营人承认公司由其经营，并不直接导致法人资格的涤除。法人资格的涤除，即法人的注销或终止，是一个复杂的法律过程，涉及多个方面的考量，不能仅凭实际经营人的承认就作出决定。以下从不同角度对此问题进行详细分析：

一、法人资格涤除的法定条件

根据《中华人民共和国公司法》及相关法律法规，法人资格的涤除（即公司注销）通常需要满足以下条件：

1. 公司解散：公司可能因股东会或股东大会决议解散、因公司合并或者分立需要解散、依法被吊销营业执照、责令关闭或者被撤销等原因而解散。
2. 清算程序：公司解散后，应依法进行清算，包括成立清算组、通知债权人、清理公司财产、编制资产负债表和财产清单、制定清算方案等步骤。
3. 注销登记：清算结束后，清算组应制作清算报告，报股东会、股东大会或者人民法院确认，并报送公司登记机关，申请注销公司登记，公告公司终止。

二、实际经营人承认经营与法人资格涤除的关系

1. 实际经营人的承认：实际经营人承认公司由其经营，这只能说明其在公司运营中的角色和责任，但并不能直接作为涤除法人资格的依据。法人资格的涤除需要遵循法定的程序和条件。
2. 法律责任的区分：即使实际经营人承认经营，如果公司存在违法行为或债务问题，法人（即公司本身）仍需承担相应的法律责任。实际经营人的承认可能影响其个人在公司债务或违法行为中的责任承担，但并不影响法人资格的涤除程序。

三、可能涉及的法律后果

1. 如果公司符合注销条件：即使实际经营人承认经营，只要公司符合注销的法定条件，并依法完成了清算和注销程序，法人资格就可以被涤除。
2. 如果公司不符合注销条件：如果公司存在未了结的债务、未完成的清算程序或其他不符合注销条件的情况，即使实际经营人承认经营，法人资格也不能被涤除。否则，可能面临法律责任，包括但不限于行政处罚、民事赔偿等。

四、建议与措施

1. 审查公司状况：在考虑涤除法人资格前，应全面审查公司的财务状况、债务情况、法律纠纷等，确保公司符合注销的法定条件。
2. 依法进行清算：如果公司决定注销，应依法成立清算组，进行清算工作，确保债权人的权益得到保障。
3. 办理注销登记：清算结束后，应及时向公司登记机关申请注销登记，完成法人资格的涤除程序。

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