针对您提出的问题，即持有汽车驾驶证但驾驶无牌农用车撞人后，司机是否会被拘留，这需要根据具体情况来分析：

1. 交通事故责任与拘留的关系：

   • 在交通事故中，如果司机存在违法行为，如超速、酒驾、无证驾驶等，且这些行为与事故的发生有直接关系，那么司机可能会面临行政处罚，包括拘留。但拘留并非交通事故的必然后果，而是取决于司机行为的违法性和严重性。

2. 驾驶无牌农用车的法律后果：

   • 驾驶无牌车辆上路是违法行为。根据《中华人民共和国道路交通安全法》的相关规定，驾驶未悬挂机动车号牌的机动车上道路行驶的，公安机关交通管理部门应当扣留机动车，并可以处警告或者二十元以上二百元以下罚款。如果司机同时存在其他违法行为，如无证驾驶（尽管此处司机有汽车驾驶证，但驾驶农用车可能需要特定资质），则处罚可能更为严重。

3. 撞人后的法律责任：

   • 如果司机在驾驶过程中撞人，且该事故被认定为交通事故，那么司机需要根据事故责任承担相应的民事赔偿责任。如果事故构成犯罪，如交通肇事罪，那么司机还可能面临刑事处罚，包括有期徒刑等。但在此情况下，拘留通常是刑事诉讼过程中的一个临时措施，而非最终处罚。

4. 是否会被拘留的具体分析：

   • 如果司机仅因驾驶无牌农用车而被查处，且未造成严重后果：一般情况下，司机可能会面临罚款和扣留车辆的处罚，但不太可能被直接拘留。
   • 如果司机在驾驶无牌农用车过程中撞人，且事故责任在司机：那么司机除了需要承担民事赔偿责任外，还可能因违反交通法规而面临行政处罚，包括可能的拘留。如果事故构成犯罪，则拘留可能是刑事诉讼过程中的一个环节。
   • 如果司机存在其他严重违法行为：如酒驾、逃逸等，那么无论事故责任如何，司机都可能面临更严重的法律后果，包括拘留。

法律建议：

• 驾驶任何车辆时，都应确保车辆合法、手续齐全，并遵守交通法规。
• 如果发生交通事故，应立即停车、保护现场、救助伤者，并报警等待处理。
• 面对法律问题，应积极配合相关部门的调查和处理，并寻求专业法律帮助以维护自身权益。

如果您或他人遇到类似情况，或有任何法律疑问，都可以直接向我咨询。我会根据您的具体情况，提供专业、全面的法律建议。