网贷逾期后协商还本金，通过微信转账的方式，在法律上本身并不直接产生负面影响，但需注意操作细节以避免潜在风险。以下从不同角度为您详细分析：

1. 转账方式的合法性

微信转账作为一种电子支付方式，其本身是合法的。在网贷逾期后，若与贷款方达成协商，同意仅偿还本金，并通过微信转账完成支付，这一行为在法律上并不被禁止。关键在于，转账前需确保与贷款方有明确的书面或可证明的口头协议，确认还款金额、方式及双方的权利义务。

2. 证据保留的重要性

• 转账记录：微信转账后，务必保留好转账记录，包括转账时间、金额、收款方信息等，作为已履行还款义务的证据。
• 协商记录：同时，建议保存与贷款方协商还款的聊天记录或书面协议，以证明双方就还款事宜达成了一致。

若缺乏这些证据，一旦贷款方事后否认协商内容或主张未收到还款，您可能面临举证困难的风险。

3. 潜在风险及防范

• 诈骗风险：需警惕不法分子冒充贷款方进行诈骗。在转账前，务必通过官方渠道核实对方身份，避免向个人账户随意转账。
• 利息及费用争议：即使协商还本金，也需明确是否包含其他费用（如逾期利息、违约金等）。若贷款方事后主张额外费用，而您未留存相关证据，可能陷入不利境地。
• 信用记录影响：虽然协商还本金本身不直接影响信用记录，但若未按照协商内容履行还款义务，或贷款方未按照约定更新您的信用记录，仍可能对您的信用造成负面影响。

4. 法律建议

• 明确协议：在协商还款时，尽量要求贷款方出具书面协议，明确还款金额、方式、时间及双方的权利义务。
• 官方渠道操作：优先通过贷款方的官方渠道（如官方APP、网站等）进行还款操作，以减少风险。
• 及时沟通：若在还款过程中遇到任何问题，及时与贷款方沟通并留存沟通记录。

5. 特殊情况处理

若贷款方拒绝接受微信转账或要求通过其他方式还款，您应尊重其要求，并按照其指定的方式进行还款。同时，务必要求贷款方出具收款凭证或更新您的还款记录。

总结：网贷逾期后协商还本金，通过微信转账的方式在法律上并不直接产生负面影响，但需注意操作细节以避免潜在风险。建议您在转账前与贷款方明确协议、保留证据，并通过官方渠道进行操作。如有任何疑问或遇到问题，可直接向我咨询。