针对钢铁企业超过产能生产的问题，其处罚方式主要依据相关法律法规，并结合具体违规情节进行判定。以下是对此问题的详细解答：
一、法律法规依据
《中华人民共和国节约能源法》：该法第七十二条规定，生产单位超过单位产品能耗限额标准用能，情节严重且经限期治理逾期不治理或未达到治理要求的，管理节能工作的部门可提出意见，报请本级人民政府按照国务院规定的权限责令停业整顿或者关闭。虽然此条直接针对的是能耗超标，但超产能生产往往与能耗超标相关联，且体现了对违规生产行为的严厉态度。
《安全生产违法行为行政处罚办法》：该办法第四十五条第(四)项等条款，对超出核定生产能力进行生产的行为有明确的处罚规定。例如，兴文县应急管理局就曾依据此办法对一家超出核定生产能力生产的建材公司进行了警告和罚款的处罚。
二、处罚方式及流程
立案：相关监管部门（如工信和科技局、应急管理局等）在发现钢铁企业存在超过产能生产的情况后，会进行审查并决定是否立案。
调查：立案后，会指定专人负责调查取证，确保调查过程合法、公正。调查人员会出示执法证件，听取当事人的辩解和陈述，并记录在案。
审查：对调查报告进行审查，包括违法事实、证据、调查取证程序、法律适用、处罚种类和幅度等方面。
告知：在作出行政处罚决定前，会制作《行政处罚事先告知书》送达当事人，告知其违法事实及享有的陈述、申辩等权利。符合听证规定的，还会制作《行政处罚听证告知书》。
决定：根据审查结果和当事人的陈述、申辩情况，制作行政处罚决定书。对于重大行政处罚，还会依照相关规定进行集体讨论。
送达与执行：行政处罚文书会按照法定方式送达当事人，并依照生效的行政处罚决定书执行决定。
三、具体处罚案例
以兴文县应急管理局对宜宾某建材公司的处罚为例，该企业安全生产许可证核定的生产规模为90万吨/年，但实际采出量超出了设计生产能力27万吨。兴文县应急管理局依据相关法律法规，对该企业给予了警告并处罚款人民币15000元的行政处罚决定，同时对矿长也给予了警告并处罚款人民币3000元的行政处罚决定。
四、建议与提醒
企业应严格遵守产能规定：钢铁企业应严格按照核定的生产能力进行生产，避免超产能生产带来的安全风险和法律风险。
加强内部管理：企业应建立健全内部管理制度，确保生产过程中的各项指标符合法律法规要求。
增强风险防范意识：企业负责人应增强风险防范意识，履行好职责，确保企业安全生产。
综上所述，钢铁企业超过产能生产将面临严厉的行政处罚，包括警告、罚款、停业整顿甚至关闭等。因此，企业应严格遵守相关法律法规，确保生产活动的合法性和安全性。