社区不让商户在停车区域停放电瓶车是否违法，需根据具体情况判断，不能一概而论。以下从不同角度进行分析：
一、社区管理权限与规定
社区管理规定：
- 社区作为管理方，有权制定内部管理规定，以维护社区的秩序和安全。如果社区的管理规定中明确禁止在停车区域停放电瓶车，且该规定不违反法律法规的强制性规定，那么商户应当遵守。
- 依据《中华人民共和国民法典》中关于建筑物区分所有权的规定，业主（包括商户）应当遵守管理规约。若社区的管理规定经过合法程序制定并公示，商户违反规定停放电瓶车，社区有权要求商户改正。
社区管理权限的边界：
- 社区的管理权限并非无限，其制定的规定不得侵犯商户的合法权益。如果社区的规定过于严苛或不合理，例如完全禁止商户在合理范围内停放电瓶车，导致商户无法正常使用其经营场所，那么商户有权提出异议。
二、商户的合法权益
使用权与通行权：
- 商户作为社区的一部分，享有对其经营场所及相关设施的使用权。如果停车区域属于商户合理使用的范围，且停放电瓶车不会对社区造成实质性影响，那么社区无权禁止。
- 依据《中华人民共和国民法典》中关于相邻关系的规定，不动产的相邻权利人应当按照有利生产、方便生活、团结互助、公平合理的原则，正确处理相邻关系。社区在制定管理规定时，应充分考虑商户的合理需求。
合法维权途径：
- 如果商户认为社区的规定侵犯了其合法权益，可以通过合法途径进行维权，如与社区协商、向相关部门投诉或提起诉讼等。
三、可能的法律后果
社区违规的法律后果：
- 如果社区的规定违反了法律法规的强制性规定，或者侵犯了商户的合法权益，那么社区可能面临法律责任。例如，如果社区因禁止停放电瓶车而导致商户经营受损，商户有权要求社区赔偿损失。
商户违规的法律后果：
- 如果商户违反社区的管理规定停放电瓶车，且该规定合法有效，那么商户可能面临社区的处罚，如罚款、限制使用某些设施等。同时，如果商户的行为对社区造成了实质性损害，还可能承担民事赔偿责任。
四、建议与解决方案
加强沟通与协商：
- 社区与商户之间应加强沟通与协商，共同制定合理的管理规定。在制定规定时，应充分考虑商户的合理需求和使用习惯，确保规定的合理性和可行性。
完善管理规定：
- 社区应完善其管理规定，明确停车区域的使用规则和限制条件。同时，应加强对规定执行情况的监督和检查，确保规定的有效实施。
寻求法律援助：
- 如果双方无法达成一致意见，或者认为对方的行为侵犯了自己的合法权益，可以寻求法律援助或咨询专业律师的意见。
如果有任何具体的法律问题或需要进一步的帮助，请直接向我咨询。我会根据你的具体情况提供详细的法律建议和解决方案。