核心结论：摩托车撞到价值100万元的车辆后，赔偿金额及方式需根据事故责任划分、保险情况及实际损失综合确定，具体如下：
1. 责任划分是赔偿的基础
- 全责或主责：若摩托车方被认定为全责或主要责任，需承担对方车辆的全部或主要维修费用（包括100万元车辆的合理维修成本）。
- 次责或无责：若摩托车方仅承担次要责任或无责，则按责任比例分担赔偿（如30%责任则赔偿总损失的30%）。
- 法律依据：根据《道路交通安全法》第76条，机动车之间发生事故，由有过错的一方承担赔偿责任；双方都有过错的，按过错比例分担。
2. 保险覆盖范围决定赔偿上限
- 交强险优先赔付：摩托车需投保交强险，财产损失赔偿限额为2000元。若对方车辆损失超过2000元，超出部分由商业险或责任方承担。
- 商业第三者责任险：若摩托车方购买了商业三者险，保险公司将在保额范围内（如50万、100万等）赔付超出交强险的部分。若保额不足，需责任方自行补足。
- 对方车辆保险：若对方车辆投保了车损险，其保险公司可能先行赔付，再向责任方追偿（代位求偿）。
3. 实际损失认定需合理
- 维修费用：以4S店或正规维修厂的定损金额为准，需提供维修发票、清单等证据。
- 折旧损失：若车辆因事故导致价值贬损（如严重修复史），对方可能主张折旧费，但司法实践中支持程度有限，需结合车龄、损伤程度等综合判断。
- 替代性交通工具费用：对方因车辆维修产生的合理交通费（如租车费）可能被支持，但需提供证据。
4. 特殊情形处理
- 摩托车无保险：若摩托车未投保交强险，责任方需自行承担交强险范围内的2000元，超出部分按责任比例分担。
- 逃逸或酒驾：若摩托车方存在逃逸、酒驾等违法行为，保险公司可能拒赔，全部损失由责任方承担。
- 协商与诉讼：双方可协商赔偿金额，若协商不成，对方可能通过诉讼解决，法院将根据证据和法律规定判决。
建议行动步骤
- 立即报警并保留证据：拍摄现场照片、视频，记录对方车辆信息及证人联系方式。
- 联系保险公司：及时报案，配合定损，避免自行承诺赔偿金额。
- 谨慎签署协议：勿轻易签署“全责协议”或私下赔偿，防止后续纠纷。
- 咨询专业律师：若涉及高额赔偿或责任争议，可进一步向我咨询具体法律策略。
提示：赔偿金额并非单纯由车辆价值决定，需结合责任比例、保险情况及实际损失综合计算。如有具体案情或证据材料，可提供详细信息以便进一步分析。