在解答您关于自诉案件第二类与第三类区别的问题时，我们首先要明确自诉案件的基本分类及其法律依据。根据《中华人民共和国刑事诉讼法》的相关规定，自诉案件主要包括以下三类：
告诉才处理的案件：这类案件通常涉及个人名誉、婚姻家庭等轻微犯罪，如侮辱罪、诽谤罪等，且法律规定必须由被害人或其法定代理人、近亲属直接向法院提起诉讼。
被害人有证据证明的轻微刑事案件（即您所指的第二类自诉案件）：这类案件的特点在于，虽然人民检察院没有提起公诉，但被害人持有足够证据证明被告人实施了轻微刑事犯罪。这里的“轻微”通常指的是犯罪情节较轻，对社会造成的危害相对较小。在第二类案件中，检察院没有提起公诉并不意味着公安机关没有进行过侦查，可能只是因为证据不足或情节轻微等原因，检察院经审查后决定不提起公诉。
被害人有证据证明对被告人侵犯其人身、财产权利的行为应当依法追究刑事责任，而公安机关或者人民检察院不予追究被告人刑事责任的案件（即您所指的第三类自诉案件）：这类案件的关键在于，被害人有充分证据表明被告人的行为构成了犯罪，且应当依法追究刑事责任，但公安机关或人民检察院却作出了不予追究的书面决定。在第三类案件中，不予追究的决定通常是在侦查终结后作出的，因此公安机关或检察院的决定必定以侦查事实的存在为前提。
第二类与第三类自诉案件的主要区别：
侦查阶段的不同：在第二类案件中，虽然检察院没有提起公诉，但公安机关可能已经进行了侦查，只是由于证据不足或情节轻微等原因未被起诉。而在第三类案件中，不予追究的决定是在侦查终结后作出的，这意味着公安机关或检察院已经完成了侦查工作，并基于侦查结果作出了不予追究的决定。
证据调取的侧重点：在第二类案件中，自诉人可能需要向法院申请调取公安机关在侦查阶段所获取的证据，以补充自己举证的不足。而在第三类案件中，自诉人同样可以申请调取相关证据，但更侧重于证明公安机关或检察院不予追究的决定存在错误或不当。
法律后果的预期：对于第二类案件，自诉人通常期望通过法院的审判来确认被告人的犯罪行为并获得相应的法律救济。而对于第三类案件，自诉人则可能更侧重于挑战公安机关或检察院的不予追究决定，寻求法律上的公正和纠正。
综上所述，第二类与第三类自诉案件在侦查阶段、证据调取的侧重点以及法律后果的预期等方面存在显著差异。希望这些解答能够帮助您更好地理解自诉案件的分类及其区别。