军人被刑事拘留三天，并不一定会有案底。这一结论主要取决于拘留的性质以及后续的法律程序。以下是对此问题的详细分析：

一、刑事拘留的性质

刑事拘留是公安机关、人民检察院在刑事案件侦查过程中，对现行犯或重大嫌疑分子采取的临时剥夺其人身自由的强制方法。它只是一种临时性的强制措施，并不代表犯罪成立或必然导致有罪判决。

二、案底的形成条件

“案底”一般指的是犯罪记录，即个人因犯罪行为被判处的刑罚记录。案底的形成需要经过司法程序审判并确认犯罪。仅仅被刑事拘留，并不意味着就会留下案底。

三、不同情况下的案底形成

1. 若最终经法院审判没有被认定为有罪：

   • 在这种情况下，军人不会被留下犯罪案底。因为刑事拘留只是一种临时性的强制措施，并未导致有罪判决。

2. 若经过侦查、审查起诉，最后被法院判决有罪：

   • 在这种情况下，军人会留下犯罪案底。因为案底的形成需要经过司法程序审判并确认犯罪，一旦被判决有罪，就会形成刑事犯罪记录。

四、对军人的特殊影响

对于军人而言，留下案底可能会对其职业生涯产生严重影响。根据《中国人民解放军纪律条令》等相关规定，军人犯罪被判处刑罚的，可能会受到开除军籍等严厉处分。此外，案底还可能对军人的就业、参军、报考公务员等方面产生限制。

五、建议与措施

1. 了解法律程序：

   • 军人及其家属应了解刑事拘留的性质和法律程序，以便更好地应对可能出现的法律问题。

2. 积极配合调查：

   • 如果军人被刑事拘留，应积极配合公安机关的调查工作，如实陈述事实，提供相关证据。

3. 寻求法律帮助：

   • 在必要时，军人及其家属可以寻求专业律师的法律帮助，以维护自身合法权益。

4. 遵守法律法规：

   • 军人应严格遵守国家法律法规和军队纪律，避免违法行为的发生。