结论：在您有意愿协商还款但银行卡仍被划扣的情况下，可能涉及银行单方面扣款行为、协商还款协议未正式生效或存在其他债务纠纷等问题。以下是从不同角度对这一问题的详细分析。
一、银行单方面扣款行为
法律依据与合同条款：
- 银行在贷款合同中通常会约定，在借款人未按期还款时，银行有权从借款人的银行账户中划扣款项以偿还贷款。这是基于合同法的自动履行条款。
- 如果您已经与银行就还款事宜进行了协商，但银行仍然划扣了您的银行卡，这可能是因为协商结果尚未以书面形式确认，或者银行内部流程尚未完成，导致扣款行为仍按原合同执行。
应对措施：
- 立即与银行联系：首先，您应立即与银行客服或贷款部门联系，说明您已经与银行协商还款，并要求银行停止进一步的扣款行为。
- 保留证据：保存好与银行协商的所有记录，包括通话记录、短信、邮件等，以备后续维权之需。
- 书面确认：如果可能，尽量与银行签订书面的还款协议，明确还款金额、期限等关键条款，以避免口头协议带来的不确定性。
二、协商还款协议未正式生效
协议生效条件：
- 协商还款协议需要双方签字盖章后才能生效。如果只是口头协商，或者一方签字后另一方未签字，协议可能尚未生效。
- 即使协议已经签字，但如果银行内部流程（如审批、盖章等）尚未完成，协议也可能尚未正式生效。
应对措施：
- 确认协议状态：与银行确认协商还款协议的签订和生效状态，确保协议已经正式生效。
- 补充协议：如果协议尚未生效，可以与银行协商补充签订一份书面协议，明确双方的权利和义务。
三、存在其他债务纠纷
债务纠纷可能性：
- 如果您除了这笔贷款外，还有其他与银行的债务纠纷（如信用卡欠款、其他贷款等），银行可能会从您的银行账户中划扣款项以偿还这些债务。
- 另外，如果您的银行账户被其他债权人申请了财产保全或强制执行，银行也可能根据法院的裁定进行扣款。
应对措施：
- 核查债务情况：仔细核查自己的债务情况，确保没有遗漏或未知的债务。
- 与债权人沟通：如果存在其他债务纠纷，应积极与债权人沟通，寻求解决方案，避免债务问题进一步恶化。
- 法律维权：如果认为银行的扣款行为侵犯了您的合法权益，可以寻求法律帮助，通过法律途径维护自己的权益。
四、建议与总结
- 保持沟通：与银行保持密切沟通，及时了解还款情况和账户变动，避免因为信息不对称而导致的问题。
- 法律意识：增强自己的法律意识，了解贷款合同和相关法律法规，以便在出现问题时能够及时应对。
- 专业咨询：如果您在处理此类问题时感到困惑或无助，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供专业的法律建议。
在处理有意愿协商还款但银行卡仍被划扣的问题时，关键在于及时与银行沟通、确认协议状态、核查债务情况，并在必要时寻求法律帮助。希望以上分析能对您有所帮助。