农民工工伤后，仅协商赔偿医药费往往是不合理的。以下从不同角度为您详细分析：

一、法律规定的工伤赔偿范围

根据《工伤保险条例》及相关法律规定，职工因工作遭受事故伤害进行治疗，享受工伤医疗待遇。这不仅仅包括医药费，若工伤职工被评定伤残等级，在停工留薪期内，原工资福利待遇不变，由所在单位按月支付。此外，经劳动能力鉴定存在伤残的，还可获得一次性伤残补助金等赔偿。若解除劳动关系，还可享受一次性工伤医疗补助金和一次性伤残就业补助金。因此，仅赔偿医药费显然未涵盖应有的赔偿项目，不符合法律规定。

二、停工留薪期工资福利

在停工留薪期内，农民工虽然无法正常工作，但其工资福利待遇应保持不变，由所在单位按月支付。这是法律对工伤职工的一种保护，确保其在治疗期间的基本生活不受影响。如果公司仅赔偿医药费，而忽略了停工留薪期的工资福利，那么这种做法是不合法的。

三、伤残等级赔偿

如果农民工经劳动能力鉴定存在伤残等级，那么除了医药费和停工留薪期工资福利外，还有权获得一次性伤残补助金。这是一项针对伤残职工的特殊赔偿，旨在弥补其因伤残而导致的长期经济损失。如果公司仅赔偿医药费，而拒绝支付一次性伤残补助金等其他赔偿项目，那么这种做法同样是不合法的。

四、生活不能自理的护理费用

对于生活不能自理的工伤职工，在停工留薪期内的护理费用也应由单位负责。这是法律对工伤职工生活照顾的一种体现，确保其在治疗期间能够得到必要的护理和照顾。如果公司仅赔偿医药费，而忽略了护理费用，那么这种做法也是不合理的。

五、维权途径

如果公司仅赔偿医药费，而拒绝支付其他应有的赔偿项目，农民工可以先与公司进行协商，寻求合理的解决方案。如果协商不成，农民工可以向劳动仲裁机构申请劳动仲裁，通过法律途径来维护自己的合法权益。

建议：农民工在工伤后，应了解自己的合法权益，不要仅满足于医药费的赔偿。如果公司拒绝支付其他应有的赔偿项目，应积极寻求法律帮助，通过协商或法律途径来维护自己的权益。如果您在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。