您好，关于您询问的高新技术企业在有效期内被取消资格的原因，根据《科技部 财政部 国家税务总局关于修订印发<高新技术企业认定管理办法>的通知》以及相关实施细则，已认定的高新技术企业若存在以下行为之一，将会被认定机构取消其高新技术企业资格：

1. 在申请认定过程中存在严重弄虚作假行为的：

   • 这意味着企业在申请高新技术企业资质时，如果提交了虚假材料、数据或信息，以骗取认定资格，一旦被发现，其高新技术企业资格将被取消。

2. 发生重大安全、重大质量事故或有严重环境违法行为的：

   • 企业在经营过程中，如果发生重大安全事故、重大质量事故，或者存在严重违反环境保护法律法规的行为，这些都将严重影响企业的社会形象和行业声誉，因此认定机构会取消其高新技术企业资格。

3. 未按期报告与认定条件有关重大变化情况，或累计两年未填报年度发展情况报表的：

   • 高新技术企业需要定期向认定机构报告其经营状况、技术创新情况等与认定条件相关的重大变化。如果企业未按期报告，或者累计两年未填报年度发展情况报表，认定机构将视为企业不再符合高新技术企业认定条件，从而取消其资格。

对于被取消高新技术企业资格的企业，认定机构还会通知税务机关，按照《税收征管法》及相关规定，追缴其自发生上述行为之日所属年度起已享受的高新技术企业税收优惠。因此，企业在获得高新技术企业资质后，应严格遵守相关规定，保持其资质的有效性。

希望以上解答能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的咨询，请随时告诉我。