交通事故二次手术已经超三年，是否还有诉讼时效，需分情况讨论：

1. 未超过诉讼时效的情况：

   • 诉讼时效一般是从知道或应当知道权利被侵害时起计算，在交通事故中，若二次手术是因首次事故导致的必然后续治疗，且受害人在第一次起诉时已经对后续治疗费提出了主张，但当时无法确定具体数额，法院可能会判决待实际发生后另行起诉。在这种情况下，诉讼时效可能从二次手术完成时起算。因此，如果二次手术完成未超过三年，且没有其他中断或中止诉讼时效的法定事由，那么起诉是未超过诉讼时效的。
   • 举例来说，甲在2018年发生交通事故受伤，进行了第一次手术治疗，并于2019年向法院起诉要求肇事方乙赔偿第一次手术的医疗费、误工费等损失，当时因二次手术尚未进行，未主张后续治疗费。2021年甲进行了二次手术，花费了一定费用。在这种情况下，甲从二次手术完成、知道确切医疗费用及侵权人为乙时起，三年内提起诉讼都不超过诉讼时效。假设甲在2022年提起关于二次手术费用的诉讼，此时距离二次手术完成未超过三年，未超过诉讼时效。

2. 可能超过诉讼时效的情况：

   • 如果二次手术与首次事故的时间间隔较长，且期间没有诉讼时效中断或中止的法定事由，那么从二次手术完成之日起算，超过三年则可能超过诉讼时效。
   • 举例来说，还是以上述案例为例，如果甲在2024年才就二次手术费用向法院提起诉讼，由于距离二次手术完成已经超过了三年，且没有诉讼时效中断、中止等法定事由，那么就超过了诉讼时效。不过，如果存在诉讼时效中断的情形，比如甲在二次手术后的一年内向乙主张过赔偿，或者乙同意履行赔偿义务等情况，那么诉讼时效会从中断、有关程序终结时起重新计算。

诉讼时效的中断与中止：

• 诉讼时效的中断：在诉讼时效期间内，如果权利人向义务人提出履行请求（如书面催款函等）、义务人同意履行义务（如肇事方或其保险公司同意赔偿）、权利人提起诉讼或申请仲裁等，诉讼时效会中断，并从中断、有关程序终结时起重新计算。
• 诉讼时效的中止：在诉讼时效期间的最后六个月内，如果因不可抗力或其他障碍不能行使请求权，诉讼时效会中止。从中止时效的原因消除之日起，诉讼时效期间继续计算。

建议与注意事项：

• 对于交通事故受害人而言，如果需要进行二次手术，建议及时关注诉讼时效问题，并在必要时咨询我，以了解具体的诉讼权利和时效管理。
• 在提起诉讼前，务必收集好相关证据材料，如医疗记录、费用清单、交通事故责任认定书等，以支持自己的诉讼请求。
• 如果担心诉讼时效问题，可以在诉讼时效期间内通过提起诉讼、向对方主张权利等方式来中断诉讼时效，确保自己的权利得到及时保护。

综上所述，交通事故二次手术已经超三年是否还有诉讼时效，需根据具体情况进行判断。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。