核心结论：住院时若发现存在未做项目却被扣费的情况，您有权要求医院核查并退还相应费用，可通过与医院协商、向卫生行政部门投诉或通过法律途径解决。以下是具体分析：

1. 核查费用清单与实际治疗项目的匹配性

• 法律依据：根据《医疗机构管理条例》第三十七条，医疗机构必须按照核准登记的诊疗科目开展诊疗活动，并按照规定公开医疗服务和收费信息。患者有权要求医院提供详细的费用清单，并核对每一项收费是否与实际治疗项目一致。
• 操作建议：首先，您应向医院医务科或财务科索取住院期间的详细费用清单，逐项核对是否与实际接受的治疗、检查、用药等相符。若发现未做项目被扣费，应立即要求医院书面说明收费依据。

2. 与医院协商解决

• 法律依据：根据《消费者权益保护法》第八条，消费者享有知悉其购买、使用的商品或者接受的服务的真实情况的权利。医院作为服务提供者，有义务确保收费透明、合理。
• 操作建议：若发现不合理收费，可先与医院协商，要求退还多收费用。协商时，建议保留费用清单、病历记录、未做项目的证明（如检查报告未生成）等证据，以增强说服力。

3. 向卫生行政部门投诉

• 法律依据：根据《医疗纠纷预防和处理条例》第二十二条，患者有权向卫生行政部门投诉医疗机构的违法违规行为。卫生行政部门有权对医院的收费行为进行调查，并责令整改。
• 操作建议：若与医院协商无果，可向当地卫生健康委员会（或卫生局）投诉，提交费用清单、病历记录、协商记录等证据。卫生行政部门通常会在规定时间内调查并反馈处理结果。

4. 通过法律途径解决

• 法律依据：根据《民法典》第九百九十六条，因当事人一方的违约行为，损害对方人格权并造成严重精神损害，受损害方有权请求精神损害赔偿。虽然医疗收费纠纷主要涉及财产权益，但若医院存在故意欺诈或重大过失，可能承担民事赔偿责任。
• 操作建议：若投诉无果，可向人民法院提起民事诉讼，要求医院退还多收费用，并可能主张因错误收费导致的其他损失（如交通费、误工费等）。诉讼时，需提交充分证据证明医院存在过错。

5. 预防措施与建议

• 住院前：了解医院收费标准，询问是否包含所有预计项目费用。
• 住院期间：定期核对费用清单，发现异常及时与医护人员沟通。
• 出院后：保留所有医疗文件，包括费用清单、病历、检查报告等，以备后续核查。

总结：住院时发现未做项目被扣费，您有权要求医院核查并退还费用。建议先与医院协商，协商无果可向卫生行政部门投诉，必要时通过法律途径解决。保留证据是关键，确保您的权益得到有效维护。如有进一步疑问，可直接向我咨询。