修改协议后有判决书，房子过户仍然是需要收费的。具体的费用项目及可能存在的减免情况如下：
一、具体费用项目
契税：
- 契税是房屋过户时必须缴纳的一项费用，通常按照房屋交易价格的一定比例来计算。
- 税率根据房屋的性质（如住宅、非住宅）以及购房者的具体情况（如是否为首次购房）等因素而定。
印花税：
- 印花税是按照房屋交易金额的一定比例来征收的。
- 在房屋过户过程中，买卖双方通常都需要缴纳印花税。
登记费：
- 登记费是办理房屋过户手续时需要缴纳的固定费用。
- 这项费用用于覆盖房屋登记机构在办理过户手续过程中产生的成本。
其他可能费用：
- 根据具体情况，还可能产生其他费用，如评估费（如果需要对房屋进行价值评估）、公证费（如果过户过程中需要公证）等。
二、费用减免或优惠
- 不同地区的具体收费标准可能会有所差异。一些地区可能会根据政策对部分费用进行减免或优惠，特别是针对特定群体（如首次购房者、低收入家庭等）。
- 因此，在办理过户手续前，建议了解当地的相关收费规定和政策，以便做好费用准备并享受可能的减免或优惠。
三、法律建议
- 提前了解费用：在办理房屋过户手续前，务必向当地房屋登记机构或相关部门咨询具体的收费标准和项目，以便做好费用预算。
- 保留相关证据：在缴纳过户费用时，务必保留好相关的缴费凭证和收据，以备后续需要。
- 咨询专业人士：如果在过户过程中遇到任何问题或疑问，建议及时咨询专业的律师或房地产中介机构，以确保过户手续的顺利进行。
从法律角度来看，修改协议后有判决书进行房子过户是需要承担一定费用的。这些费用是办理过户手续过程中必不可少的部分。因此，在办理过户手续前，请务必了解并准备好相关费用。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。