您好，非常理解您当前面临的困境，关于户口没有跟爸爸在一起，且爸爸已经不在世的情况下如何进行亲子鉴定的问题，我会为您详细解答。
首先，需要明确的是，如果父亲已经去世，传统的直接亲子鉴定（即父母与子女之间的鉴定）确实无法进行，因为无法直接采集到父亲的样本。但是，这并不意味着无法确认您与父亲之间的亲缘关系，还有其他几种鉴定方式可以考虑：
祖孙关系鉴定：
- 如果您的爷爷奶奶还在世，您可以考虑进行祖孙关系鉴定。通过鉴定您与爷爷奶奶之间的亲缘关系，可以间接推断出您与父亲之间的亲缘关系。
全同胞关系鉴定：
- 如果您有同父同母的兄弟姐妹，您还可以考虑进行全同胞关系鉴定。通过鉴定您与兄弟姐妹之间的亲缘关系，同样可以推断出您与父亲的关系。
叔侄/姑侄关系鉴定：
- 如果以上两种情况都不适用，您还可以考虑进行叔侄或姑侄关系鉴定。通过鉴定您与叔叔或姑姑之间的亲缘关系，间接推断出您与父亲的关系。虽然这种方式相对间接，但在某些情况下仍然是一个可行的选择。
遗体或遗留样本鉴定（如果适用）：
- 如果父亲去世后遗体还未火化，或者有遗留的生物检材（如血液、组织等）保存在公安部门或医院等相关单位，并且这些单位同意交付样本进行鉴定，那么也可以考虑进行遗体或遗留样本鉴定。但这种情况比较特殊，需要满足一定的条件。
注意事项：
- 在选择鉴定方式时，请务必考虑实际情况和可行性。
- 一定要选择有资质的正规鉴定机构进行鉴定，以确保结果的准确性和可靠性。
- 鉴定前请仔细阅读鉴定机构的指导说明，确保样本采集的规范性和有效性。
- 如果鉴定结果需要用于法律用途（如户口办理、遗产继承等），请务必选择司法亲子鉴定，并确保鉴定机构具有相应的司法鉴定资质。
最后，我想强调的是，虽然父亲已经不在世，但您仍然有多种方式可以确认与父亲之间的亲缘关系。希望这些建议能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的帮助，请随时告诉我。