针对营运客车拉学生（尤其是超员拉载）的处罚问题，这主要取决于超员的严重程度以及是否涉及非法营运等因素。以下是根据相关法律法规和实际案例的详细解答：
一、超员拉载学生的处罚
一般超员情况：
- 如果营运客车超员但未达到严重超员的标准（即未超过额定乘员的20%以上），通常会面临交通管理部门的罚款和扣分处罚。例如，某案例中，客车因超员被处以驾驶证扣6分、罚款300元的处罚。
严重超员情况：
- 根据《中华人民共和国刑法修正案(九)》的规定，从事校车业务或者旅客运输，严重超过额定乘员载客的，构成“危险驾驶罪”。这意味着，如果营运客车严重超员（如超员率达到或超过100%），驾驶人可能面临拘役和罚金的刑事处罚。例如，某案例中，驾驶人因严重超员载客被判处拘役一个月十五日，缓刑4个月，并处罚金3000元。
二、非法营运的处罚
- 如果营运客车未取得营运资质而擅自拉载学生，这属于非法营运行为。非法营运不仅违反了交通运输管理法规，还严重威胁了学生的安全。对于此类行为，交通管理部门会依法进行严厉处罚，包括但不限于罚款、没收违法所得、扣留车辆等。在极端情况下，如果非法营运行为导致了严重后果（如交通事故），驾驶人还可能面临刑事责任的追究。
三、其他相关处罚和措施
- 除了对驾驶人的处罚外，交通管理部门还会向客运公司通报案情，要求企业加强源头安全监管，堵塞管理漏洞。这有助于从源头上预防类似违法行为的发生。
- 对于超员车辆，交通管理部门会要求立即转运超员乘客，以确保学生的安全。
四、建议与提醒
- 作为营运客车的驾驶人或车主，应严格遵守交通运输管理法规，不得超员拉载学生或进行非法营运。
- 家长和学生也应提高安全意识，选择合法、安全的交通工具上下学。
- 如果发现营运客车存在超员或非法营运行为，应及时向交通管理部门举报。
综上所述，营运客车拉学生的处罚取决于超员的严重程度以及是否涉及非法营运等因素。为了保障学生的安全，驾驶人和车主应严格遵守相关法律法规，避免违法行为的发生。