针对您提出的“补缴税款后仍被羁押怎么处理”的问题，这通常涉及到税收法律与刑事诉讼程序的交叉领域，我会结合相关法律法规和司法实践，为您详细解答。

首先，我们需要明确的是，补缴税款是纳税人履行其税收义务的重要方式。根据最高人民法院、最高人民检察院联合发布的《关于办理危害税收征管刑事案件适用法律若干问题的解释》，纳税人在公安机关立案前，如果经税务机关依法下达追缴通知后，能在规定的期限或者批准延缓、分期缴纳的期限内足额补缴应纳税款，并缴纳滞纳金，同时全部履行税务机关作出的行政处罚决定，那么通常不予追究刑事责任。但这一规定有例外，即五年内因逃避缴纳税款受过刑事处罚或者被税务机关给予二次以上行政处罚的除外。

然而，如果您已经补缴了税款，但仍然被羁押，这可能涉及到以下几种情况：

1. 补缴时间晚于公安机关立案时间：

   • 如果您在公安机关已经立案后，才进行税款补缴，那么根据相关法律规定，这可能不足以避免刑事责任的追究。因为《解释》明确将补缴税款的期限规定至公安机关刑事立案前。

2. 存在其他违法行为：

   • 除了逃税行为外，如果您还存在其他违法行为，如伪造、变造、隐匿、擅自销毁账簿、记账凭证等，这些行为可能单独构成犯罪，导致您即使补缴了税款，仍然需要承担刑事责任。

3. 补缴不彻底或存在欺诈行为：

   • 如果您在补缴税款时存在欺诈行为，如部分补缴、虚假补缴等，或者补缴的金额不足以覆盖应纳税款和滞纳金，那么税务机关或司法机关可能不会认可您的补缴行为，从而继续追究您的刑事责任。

针对您当前的情况，我建议您采取以下措施：

• 及时与税务机关和司法机关沟通：

  • 主动向税务机关和司法机关说明您已经补缴税款的情况，并提供相关证据，如补缴凭证、税务机关的确认函等。

• 咨询专业律师：

  • 寻求专业律师的帮助，了解您的法律权益和可能的辩护策略。律师可以根据您的具体情况，为您提供法律意见和辩护方案。

• 配合调查和诉讼程序：

  • 积极配合税务机关和司法机关的调查和诉讼程序，如实提供相关信息和证据。避免采取逃避、抗拒等行为，以免加重您的法律责任。

最后，我需要强调的是，税收法律是严肃且复杂的，任何违法行为都可能带来严重的法律后果。因此，建议您在未来的经营活动中，严格遵守税收法律法规，避免再次陷入类似的法律困境。