公司将奖金申报成工资，员工可以进行申诉。针对这一问题，我们可以从以下几个方面进行分析：

一. 奖金与工资的法律定义及区别

1. 奖金定义：奖金是用人单位根据员工的工作表现、业绩等因素，额外给予的奖励，通常不属于基本薪资范畴。
2. 工资定义：工资是用人单位根据劳动合同或国家规定，定期支付给员工的劳动报酬，包括基本工资、津贴、补贴等。
3. 区别：奖金通常具有不确定性，而工资则是相对固定的。将奖金申报成工资，可能涉及对员工劳动报酬的误导性陈述。

二. 申诉的法律依据

1. 《中华人民共和国劳动法》：该法规定了员工享有获得劳动报酬的权利，以及用人单位应当如实记录并支付员工劳动报酬的义务。
2. 《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》：该法为员工提供了在发生劳动争议时，通过调解、仲裁等方式维护自己合法权益的途径。

三. 申诉的具体途径

1. 与用人单位协商：首先，员工可以尝试与用人单位进行沟通，了解奖金被申报成工资的具体原因，并表达自己的诉求。
2. 向劳动监察部门投诉：如果协商无果，员工可以向当地的劳动监察部门投诉，请求其对用人单位的违法行为进行调查和处理。
3. 申请劳动仲裁：若劳动监察部门未能解决问题，员工还可以根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》的规定，向劳动仲裁委员会申请仲裁，以维护自己的合法权益。

四. 申诉的注意事项

1. 保留证据：员工在申诉前，应尽可能收集并保留与奖金、工资相关的证据，如劳动合同、工资单、奖金发放记录等。
2. 及时申诉：员工应在发现奖金被申报成工资后，及时采取申诉措施，以避免因超过时效而丧失维权机会。

综上所述，公司将奖金申报成工资，员工完全有权进行申诉。我建议员工在申诉前做好充分的证据收集工作，并选择合适的申诉途径来维护自己的合法权益。如有进一步需要，您可以继续咨询我。