《涉密信息系统集成资质管理办法》不属于法规，而是属于部门规章。具体分析如下：

一. 法规与部门规章的区别

1. 法规：通常指的是由国务院制定的行政法规，以及由省、自治区、直辖市和设区的市、自治州的人民政府根据法律、行政法规和本省、自治区、直辖市的地方性法规制定的地方政府规章。

2. 部门规章：则是由国务院各部、委员会、中国人民银行、审计署和具有行政管理职能的直属机构，根据法律和国务院的行政法规、决定、命令，在本部门的权限范围内制定的规章。

二. 《涉密信息系统集成资质管理办法》的性质

• 制定主体：该办法是由国家保密局等国务院部委制定的。
• 法律位阶：根据上述区别，由国家保密局等国务院部委制定的规范性文件，应归类为部门规章而非法规。

三. 结论

• 因此，《涉密信息系统集成资质管理办法》作为由国家保密局等国务院部委制定的规范性文件，其性质属于部门规章，而非法规。

我的观点是，准确理解法律文件的性质对于正确适用和遵守这些文件至关重要。如有进一步需要，您可以继续咨询我。