科研项目收到承兑，应首先确认承兑的性质与来源，再依据相关法律法规和合同约定进行处理。

一. 确认承兑的性质与来源

1. 承兑定义：承兑是指汇票付款人承诺在汇票到期日支付汇票金额的票据行为。在科研项目中，承兑可能来自于项目资金、合作方的付款、或是其他形式的资助。
2. 来源核查：需仔细核查承兑的来源，确保资金合法、合规，避免涉及不当得利或非法资金。

二. 依据法律法规处理

1. 票据法规定：根据《中华人民共和国票据法》的相关规定，承兑必须记载于汇票的正面，且承兑不得附有条件。如有条件，视为拒绝承兑。因此，在收到承兑时，应检查其是否符合法律规定。
2. 税法规定：科研项目收到的承兑，如涉及收入，需按照税法规定进行申报和纳税。具体税额和纳税方式需依据税法及其实施细则确定。

三. 依据合同约定处理

1. 合同条款：检查科研项目的相关合同，特别是关于资金支付、承兑接受等条款，确保承兑的接受符合合同约定。
2. 合同执行：如承兑符合合同约定，则按照合同约定的流程进行接受和处理；如不符合，需及时与对方沟通，明确处理方式。

四. 实际操作建议

1. 建立台账：为科研项目建立专门的承兑台账，记录承兑的收到、使用、核销等情况，确保资金管理的清晰和合规。
2. 及时沟通：在收到承兑后，及时与项目合作方或资金提供方进行沟通，确认承兑的意图和用途，避免误解或纠纷。

我建议，在处理科研项目收到的承兑时，应严格遵守法律法规和合同约定，确保资金的合法、合规使用。同时，加强内部管理和沟通，确保承兑的顺利处理。如有进一步需要，您可以继续咨询我。