公司撤销登记后，股东出资的处理需遵循严格的法律程序，主要方式包括合法减资、股权转让以及特定情形下的股东退股。以下是对这些处理方式的详细阐述：
一、合法减资
决议与表决：
- 有限责任公司须经代表三分之二以上表决权的股东通过减资决议；股份有限公司则须经出席股东大会会议的股东所持表决权的三分之二以上通过。决议中应明确减资的数额及具体方案。
编制资产负债表和财产清单：
- 公司应在作出减资决议之日起十日内编制资产负债表和财产清单，以清晰反映公司的财务状况。
通知与公告债权人：
- 公司需在决议后十日内通知债权人，并于三十日内在报纸上公告。债权人自接到通知书之日起三十日内，未接到通知书的自公告之日起四十五日内，有权要求公司清偿债务或者提供相应的担保。
变更登记：
- 完成上述步骤后，公司应在公告之日起45日后向公司登记机关申请变更登记，并提交相关文件，如公司法定代表人签署的变更登记申请书、减资决议、修改后的公司章程等。
二、股权转让
内部转让：
- 有限责任公司的股东之间可以相互转让其全部或者部分股权，无需经过其他股东同意。
外部转让：
- 股东向股东以外的人转让股权，应当经其他股东过半数同意。股东应就其股权转让事项书面通知其他股东征求同意，其他股东自接到书面通知之日起满三十日未答复的，视为同意转让。其他股东半数以上不同意转让的，不同意的股东应当购买该转让的股权；不购买的，视为同意转让。
三、股东退股（符合法定情形）
异议回购请求权：
- 在特定情况下，如公司连续五年不向股东分配利润，而公司该五年连续盈利，并且符合本法规定的分配利润条件的；公司合并、分立、转让主要财产的；公司章程规定的营业期限届满或者章程规定的其他解散事由出现，股东会会议通过决议修改章程使公司存续的。对股东会该项决议投反对票的股东可以请求公司按照合理的价格收购其股权。
公司僵局解散：
- 当公司经营管理发生严重困难，继续存续会使股东利益受到重大损失，通过其他途径不能解决的，持有公司全部股东表决权百分之十以上的股东，可以请求人民法院解散公司。公司解散后，需进行清算，清偿债务后的剩余财产，按照股东的出资比例分配。
四、注意事项
合法性：
- 所有撤资操作必须严格遵守《公司法》及相关法律法规的规定，避免因违法操作而引发的法律纠纷。
债权人保护：
- 在减资过程中，应充分考虑债权人的利益，按照法定程序通知和公告债权人，并妥善处理债务问题。
税务处理：
- 撤资所得可能涉及税务问题，股东应咨询专业税务人员，确保税务处理的合规性。
公司章程：
- 公司章程可能对撤资有特别规定，操作时应特别注意并遵守公司章程的规定。
若公司未经法定程序撤销股东投资，可能面临法律责任。股东可以通过内部沟通协商或提起诉讼等方式维护自己的权益，要求公司纠正错误行为或赔偿损失。同时，债权人也有权要求股东在减资范围内对公司债务承担补充赔偿责任。
综上所述，公司撤销登记后股东出资的处理是一个复杂且敏感的法律过程，必须严格遵循法律规定和公司章程的要求。无论是通过合法减资、股权转让还是特定情形下的股东退股，都应确保程序的合法性和合规性，以充分保护各方利益，特别是债权人的利益。若您在此过程中遇到任何法律问题，可以直接向我咨询。