针对您提出的“公司档案丢失纪检怎么处理”的问题，这主要涉及到《中华人民共和国档案法》的相关规定以及纪检部门在处理此类事件时的常规流程。以下是我为您提供的详细解答：
一、法律依据
根据《中华人民共和国档案法》（2020年修订）第四十八条，单位或者个人有丢失属于国家所有的档案的行为之一，将由县级以上档案主管部门、有关机关对直接负责的主管人员和其他直接责任人员依法给予处分。这意味着，如果公司档案丢失，且这些档案属于国家所有，那么相关责任人员可能会面临行政处分。
二、纪检处理流程
发现与举报：
- 纪检部门可能通过内部自查、员工举报或外部投诉等途径发现公司档案丢失的情况。
立案审查：
- 一旦发现或接到举报，纪检部门将进行审查，决定是否立案。立案的依据主要是《中华人民共和国档案法》的相关规定。
调查取证：
- 对立案的案件，纪检部门将组织调查取证。调查时，执法人员不得少于两人，且应出示执法身份证件。他们将收集相关证据，包括档案丢失的具体情况、责任人员的身份和职责等。
审查与处理意见：
- 纪检部门将对违法事实、证据、调查取证程序、法律适用、处罚种类和幅度、当事人陈述和申辩理由等方面进行审查，并提出处理意见。
行政处罚决定：
- 在作出行政处罚决定之前，纪检部门应告知当事人处罚的事实、理由和依据，以及其依法享有的陈述、申辩等权利。如果符合听证规定，还将组织听证。
- 行政处罚决定书将载明违法行为、处罚依据、处罚种类、时间、地点以及行政机关名称，并由执法人员签名或盖章。
执行与监督：
- 纪检部门将责令当事人改正或限期改正违法行为。如果当事人逾期不履行行政处罚决定，纪检部门将依法采取措施或申请人民法院强制执行。
- 同时，纪检部门还将监督实施情况，确保处罚得到有效执行。
三、可能面临的处罚
- 根据《中华人民共和国档案法》第四十九条，如果公司利用档案馆的档案时发生丢失行为，将由县级以上档案主管部门给予警告，并对单位处一万元以上十万元以下的罚款，对个人处五百元以上五千元以下的罚款。
- 如果档案服务企业在服务过程中发生丢失行为，也将受到类似的处罚，但罚款金额可能更高。
四、建议与预防措施
- 加强档案管理：公司应建立健全的档案管理制度，确保档案的安全存储和及时归档。
- 提高员工意识：通过培训和教育，提高员工对档案重要性的认识，减少因疏忽或故意行为导致的档案丢失。
- 定期自查：公司应定期进行档案自查，及时发现并纠正潜在的问题。
综上所述，如果公司档案丢失且属于国家所有，纪检部门将依据《中华人民共和国档案法》的相关规定进行立案审查、调查取证、审查处理意见、作出行政处罚决定并执行监督。公司应加强档案管理、提高员工意识并定期自查，以预防类似事件的发生。