结论：在非法经营流水五百万获利两万，且取保候审快满一年的情况下，案件可能会进入下一个法律程序阶段，如审查起诉或审判，具体结果取决于案件证据、情节及司法机关的处理。
分析如下：
一、案件可能进入的法律程序阶段
审查起诉阶段：
- 取保候审期间，公安机关会继续侦查案件，收集证据。一旦侦查终结，公安机关会将案件移送检察院审查起诉。
- 检察院在审查起诉阶段会全面审查案件证据，包括非法经营的流水、获利情况等，以决定是否对犯罪嫌疑人提起公诉。
审判阶段：
- 如果检察院决定提起公诉，案件将进入审判阶段。法院将依法审理案件，根据证据和法律规定作出判决。
- 在审判阶段，法院会考虑非法经营的数额、情节、社会危害程度等因素，以确定犯罪嫌疑人的刑事责任。
二、影响案件结果的因素
案件证据：
- 案件证据是决定案件结果的关键因素。包括非法经营的交易记录、获利证明、证人证言等。
- 如果证据充分、确凿，能够证明犯罪嫌疑人的非法经营行为，那么案件结果可能对犯罪嫌疑人不利。
案件情节：
- 案件情节也是影响案件结果的重要因素。包括非法经营的持续时间、规模、手段等。
- 如果非法经营行为情节严重，社会危害程度大，那么犯罪嫌疑人可能面临更严厉的刑事处罚。
司法机关的处理：
- 司法机关的处理方式也会影响案件结果。包括公安机关的侦查力度、检察院的起诉决定、法院的审判态度等。
- 司法机关在处理案件时会遵循法律规定和司法原则，确保案件的公正、公平处理。
三、取保候审期满后的可能情况
取保候审解除：
- 如果取保候审期满，且案件尚未终结，公安机关可能会根据案件情况决定是否解除取保候审措施。
- 解除取保候审并不意味着案件结束，犯罪嫌疑人仍需配合司法机关的处理。
继续羁押或逮捕：
- 如果案件证据充分、情节严重，且犯罪嫌疑人存在逃跑、毁灭证据等风险，司法机关可能会决定继续羁押或逮捕犯罪嫌疑人。
四、建议与注意事项
积极配合司法机关：
- 在取保候审期间及后续法律程序中，犯罪嫌疑人应积极配合司法机关的工作，如实陈述事实、提供证据。
寻求专业法律帮助：
- 鉴于案件涉及非法经营等经济犯罪问题，建议犯罪嫌疑人及时寻求专业律师的法律帮助，以维护自身合法权益。
关注案件进展：
- 犯罪嫌疑人应密切关注案件进展，及时了解司法机关的处理决定和案件结果。
如果有任何法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。