工程质保金的退还时间主要依据合同中的明确约定，并受相关法律法规的约束。在合同无约定或约定不明时，需遵循相关司法解释及行业惯例。以下是对该问题的详细阐述：

一、合同有明确约定的情况

1. 缺陷责任期届满后退还：

   • 发包人与承包人应在建设工程合同中明确约定缺陷责任期，该期限通常为1年，最长不超过2年。
   • 缺陷责任期届满且工程无质量问题或已修复的，发包人应按约定退还质保金。

2. 分阶段退还：

   • 合同也可约定按工程进度分阶段退还质保金，例如竣工验收合格后退还一定比例，缺陷责任期届满一半时再退还部分，剩余部分在缺陷责任期届满后全部退还。

二、合同无约定或约定不明的情况

1. 协议补充：

   • 若合同对质保金退还时间无约定或约定不明确，双方应首先通过协商达成补充协议，明确退还时间和方式。

2. 依据合同相关条款或交易习惯：

   • 无法达成补充协议时，可根据合同其他相关条款或行业交易习惯确定退还时间。例如，参考类似工程的质保金退还惯例。

3. 法定程序：

   • 仍无法确定退还时间时，承包人可向发包人提交返还保证金申请。
   • 发包人应在接到申请后14天内核实，无异议后14天内退还质保金。
   • 逾期未退还的，发包人需承担违约责任，包括支付逾期利息或赔偿承包人因此遭受的损失。

三、特殊情况的影响

1. 工程未经验收但发包人擅自使用：

   • 若工程未经验收，但发包人擅自使用，则以转移占有建设工程之日为竣工日期。
   • 质保金退还时间从该日期起算，但需注意，此时发包人仍需对工程质量承担一定责任。

2. 工程质量问题：

   • 质保期内出现质量问题的，承包人应按约定进行维修。
   • 若承包人未按约定维修，发包人可自行或委托第三方维修，费用从质保金中扣除。
   • 退还时间和金额将根据实际维修情况调整，可能扣除部分或全部质保金用于维修。

四、承包方的权益保护

• 承包方应在签订合同时明确质保金的退还方式和时间，避免后续纠纷。
• 工程竣工后，承包方应及时与发包方沟通协商，确保质保金按时退还。
• 如遇退还纠纷，承包方可依法采取法律手段维护自身权益，如向法院提起诉讼或申请仲裁。

建议：在实际操作中，双方应严格遵守合同约定和相关法律法规，确保质保金的退还过程合法、合规。同时，承包方在签订合同时应仔细审查合同条款，特别是关于质保金退还的约定，以避免后续纠纷。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。