商标侵权案刑事结案后，民事诉讼时效一般自权利人知道或应当知道权利受到损害以及义务人之日起三年内开始计算。以下是对此问题的详细解析：

一、诉讼时效的基本规定

根据《中华人民共和国民法典》第一百八十八条的规定，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间通常为三年。这一规定同样适用于商标侵权案件中的民事诉讼部分。即商标注册人或利害关系人自知道或应当知道其商标权利受到损害以及明确的义务人之日起三年内，有权向人民法院提起民事诉讼以维护自身权益。

二、诉讼时效的起算点

1. 一般情况：诉讼时效期间自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。在商标侵权案件中，这通常意味着商标注册人或利害关系人发现侵权行为并确认侵权人身份的时间点。

2. 特殊情况：

   • 连续侵权行为：对于持续发生的商标侵权行为，诉讼时效期间的起算点并非从首次侵权开始，而是从侵权行为终了之日起计算。这意味着，只要侵权行为未停止，诉讼时效就不会开始计算。
   • 刑事结案后的影响：在商标侵权案刑事结案后，若权利人决定提起民事诉讼，诉讼时效的起算点通常不受刑事结案时间的影响，而是依据权利人知道或应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。但需注意，若刑事程序中已对民事赔偿部分作出处理，且权利人已接受该处理结果，则可能影响其后续提起民事诉讼的权利。

三、诉讼时效的中断与中止

1. 诉讼时效中断：在诉讼时效期间内，如果商标注册人或利害关系人采取了诸如向侵权人提出索赔要求、向有关部门投诉或向法院提起诉讼等行动，将导致诉讼时效中断。从中断时起，诉讼时效期间将重新计算三年。例如，在刑事结案后，权利人向侵权人发送警告函要求停止侵权并赔偿损失，即可视为导致诉讼时效中断的行为。

2. 诉讼时效中止：在诉讼时效期间的最后六个月内，如果因不可抗力或其他障碍（如自然灾害、重大疾病等）导致商标注册人或利害关系人无法行使请求权，诉讼时效将中止。从中止时效的原因消除之日起，诉讼时效期间将继续计算。

四、法律建议

1. 及时行动：商标注册人和利害关系人在发现侵权后应及时采取行动，包括收集证据、评估侵权情况、考虑是否采取行政手段以及决定是否向法院提起诉讼等。

2. 关注诉讼时效：在采取行动的同时，也应注意关注诉讼时效的起算、中断和中止等相关规定，以确保在法律规定的期限内有效维护自己的商标权利。

3. 咨询专业律师：虽然在此问题中我作为专业律师给出了详细解答，但在实际案件中，每个案件的具体情况都可能有所不同。因此，建议商标注册人和利害关系人在遇到具体问题时咨询专业律师以获取更准确的法律建议。

综上所述，商标侵权案刑事结案后，民事诉讼时效一般自权利人知道或应当知道权利受到损害以及义务人之日起三年内开始计算。但需注意特殊情况下的起算点调整以及诉讼时效的中断与中止规定。