在专用合同条款中，合同解释的优先顺序通常遵循以下原则和顺序：
特定性条款优于一般性条款：
- 条款内容越具体、特定，就越可能反映当事人的真实意图。因此，在解释合同时，应优先考虑那些针对特定情况或具体事项的条款，而非泛泛而谈的一般性条款。
手写条款优于印刷条款：
- 在合同中，手写条款往往被视为双方特别约定的内容，其重要性通常高于预先印刷好的标准条款。因此，在解释合同时，如果手写条款与印刷条款存在冲突，应优先采纳手写条款的解释。
“明示其一即排除其他”规则：
- 如果合同中明确列出了某些事项或条件，并且没有提及其他相关事项或条件，那么可以认为双方已经通过明示的方式排除了其他可能性。在解释合同时，应遵循这一原则，避免对未明确提及的事项进行不必要的推测或解释。
不利解释规则：
- 如果一方提供的条款或用语可以合理地作出两种解释，且这两种解释对双方的权利义务产生不同影响时，应选择不利于条款或用语提供人的解释。这一规则旨在保护相对弱势方的利益，防止强势方利用模糊条款进行不公平的交易。
除了上述原则外，合同解释的优先顺序还可能受到以下因素的影响：
合同协议书的优先性：
- 在建设工程等复杂合同中，合同协议书通常作为合同的核心文件，明确了双方的基本权利义务和关键条款。因此，在解释合同时，合同协议书往往具有最高的优先权。
中标通知书、投标函等文件的优先性：
- 在招投标过程中，中标通知书和投标函等文件也是合同的重要组成部分。它们反映了双方在招投标阶段的真实意图和承诺，因此在解释合同时也应给予充分考虑。
专用合同条款与通用合同条款的优先性：
- 专用合同条款是针对特定项目制定的详细规定，具有高度的针对性和灵活性。而通用合同条款则适用于多数合同项目的标准条款。在解释合同时，如果专用合同条款与通用合同条款存在冲突，应优先采纳专用合同条款的解释。
在实际操作中，为了明确合同解释的优先顺序并减少后续争议，建议当事人在合同中明确约定解释顺序。例如，可以在合同中规定：“本合同的解释顺序依次为：合同协议书、中标通知书、投标函及其附录、专用合同条款及其附件、通用合同条款……”。这样的约定有助于确保合同条款的准确理解和适用，维护双方的合法权益。
最后，需要强调的是，合同解释的优先顺序并非绝对。在实际操作中，还需要结合合同的具体条款、性质、目的以及诚信原则等因素进行综合判断。如果遇到复杂的合同解释问题，建议直接向我咨询，以便获得更具体、更专业的法律建议。