借用别人的车闯红灯，扣分的是实际驾驶人（即借车人）的驾驶证分数。以下从不同角度为您详细分析：

一、交通违法行为的责任归属

根据《中华人民共和国道路交通安全法》及相关规定，交通违法行为是由实际驾驶车辆的人实施的，因此应由实际驾驶人承担法律责任。闯红灯是一种严重的交通违法行为，根据法律规定，应处以罚款并记分。具体来说，机动车驾驶人闯红灯的，一次记六分，罚款20-200元。这一记分和罚款是针对驾驶人的，而不是针对车辆的。

二、驾驶证记分的原则

驾驶证记分是针对驾驶人的，而不是针对车辆的。当车辆发生交通违法行为时，交警部门会根据监控录像、现场执法记录等证据确定实际驾驶人，并对其实施记分处罚。因此，在借用别人车辆闯红灯的情况下，扣分的是实际驾驶人的驾驶证分数。

三、车主的责任与风险

虽然车主在将车辆借给他人时需要确保对方具备合法驾驶资格，但一旦车辆被借出后发生的交通违法行为，原则上由实际驾驶人承担责任。车主只是将车辆借给他人使用，只要车主在借车时尽到了合理的审查义务，比如确认借车人有合法的驾驶资格等，那么车主一般不需要对借车人在驾驶过程中的违法行为承担记分责任。

然而，如果车主明知对方不具备驾驶资格或存在其他不适合驾驶的情况而仍然借车，可能会因未尽到合理审查义务而承担一定的连带责任。但这并不改变实际驾驶人应承担的交通违法责任。

四、特殊情况下的处理

如果实际驾驶人无法确定（如车辆被盗抢期间发生的交通违法行为），车主可能需要先配合调查并提供相关证据。在某些情况下，如果车主能够证明自己对交通违法行为的发生没有过错（如车辆被他人未经允许擅自使用），可能不需要承担记分等直接责任。但这种情况较为罕见，且需要车主提供充分的证据来证明自己的清白。

五、实际处理流程

如果是电子眼拍摄的闯红灯行为，车主应及时要求实际驾驶人去车管所处理车辆的违章情况。此时，实际驾驶人只需要带着身份证、驾驶证以及车主行驶证到车管所处理即可。车主应积极配合实际驾驶人处理违章，以免因拖延处理而导致不必要的麻烦和损失。

总结与建议：

借用别人的车闯红灯，扣分的是实际驾驶人的驾驶证分数。车主在借车时应尽到合理的审查义务，确保借车人具备合法驾驶资格。一旦发生交通违法行为，车主应积极配合实际驾驶人处理违章。如果您在处理此类问题时遇到任何困难或疑问，可以直接向我咨询，我会为您提供专业的法律帮助。