员工自动离职后，工资一般应在离职时或合理短时间内结算，特殊情形下可能涉及经济补偿或员工赔偿单位损失等情况，但工资结算时间会受此影响而有所调整。具体分析如下：

常规情况下的工资结算时间

• 离职时一次性结清：根据相关法律规定，用人单位在解除或终止劳动合同时需一次性付清劳动者工资。员工自动离职时，对于其已付出劳动部分，单位必须支付报酬。因此，在常规情况下，员工在办理好离职手续后，单位就应一次性结清工资。例如，单位每月固定某一日发工资，员工自动离职后，若已办理好离职手续且无其他特殊情况，仍会在该日期发放其应得工资；若离职手续办理较快，也可能在离职当日就结清工资。

特殊情形下的工资结算时间

• 存在工资支付障碍时：若因无工资卡、无法联系本人等工资支付障碍，导致用人单位无法及时支付工资的，用人单位可以暂缓工资支付，但应及时与员工沟通，尽快完成工资结算与支付。
• 员工自动离职给单位造成损失时：若员工自动离职给用人单位造成经济损失，用人单位可按照劳动合同约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除，但每月扣除部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。在这种情况下，工资支付可能会因核算赔偿金额等因素而稍有延迟，但用人单位也需及时与员工沟通，明确赔偿金额及工资结算时间。例如，员工自动离职后，单位发现其工作期间造成了设备损坏等经济损失，需核算赔偿金额，此时工资结算可能会在核算完成后进行。

法律风险提示

• 单位违法未足额支付报酬时：若单位存在未及时足额支付劳动报酬等违法情形，员工自动离职属于依法解除劳动合同，此时单位除支付工资外，还可能需支付经济补偿。经济补偿按劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资；六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，支付半个月工资。
• 单位未及时解除劳动关系时：实际操作当中，企业如果没有及时解除与自动离职员工的劳动合同，且员工反悔要求继续履行劳动合同，或者要求缴纳期间的社会保险等，用人单位极有可能面临败诉的风险。因此，单位在员工不辞而别的情况下，应积极履行通知解除劳动关系的程序，以避免可能发生的争议和风险。

建议：作为员工，在自动离职前应尽量与单位沟通好离职事宜，包括工资结算时间等，避免产生不必要的纠纷。若已自动离职且对工资结算有疑问，可及时与单位协商或寻求法律帮助。作为用人单位，应严格按照法律规定及时足额支付员工工资，在员工自动离职时及时办理离职手续并结算工资，若因员工原因造成损失需赔偿的，也应按照合法程序进行。有问题可以直接向我咨询。