物权登记超过20年，在特定情况下仍然可以重新确定份额。

一. 分析物权登记超过20年的法律效果

1. 物权登记的效力：根据《民法典》第二百零九条，不动产物权的设立、变更、转让和消灭，经依法登记，发生效力。物权登记是物权变动的公示方式，具有法律效力。

2. 诉讼时效与物权保护：

   • 普通诉讼时效：根据《民法典》第一百八十八条，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。但此规定主要适用于债权请求权，而非物权请求权。
   • 最长权利保护期间：同样根据《民法典》第一百八十八条，自权利受到损害之日起超过二十年的，人民法院不予保护，但有特殊情况的，人民法院可以根据权利人的申请决定延长。这一规定主要针对的是权利人长期不行使权利，导致法律关系长期处于不确定状态的情况。然而，对于不动产物权和登记的动产物权的权利人请求返还财产的请求权，则不适用诉讼时效的规定（见《民法典》第一百九十六条）。

二. 物权份额重新确定的情形

1. 基于共有关系的变化：如果物权是基于共有关系而设立的，如按份共有或共同共有，当共有关系发生变化时（如共有人之间达成协议、共有物被分割等），可以重新确定份额。这种情况下，物权登记超过20年并不影响份额的重新确定，因为份额的重新确定是基于共有关系的变化，而非基于诉讼时效的考虑。

2. 基于法律规定或法院判决：在某些情况下，法律可能规定或法院可能判决对物权份额进行重新确定。例如，在遗产继承中，如果遗产为共有物，法院可能根据法律规定或实际情况对遗产份额进行划分。这种情况下，物权登记超过20年同样不影响份额的重新确定。

三. 实际操作中的注意事项

1. 证据要求：在重新确定物权份额时，当事人需要提供充分的证据证明共有关系的变化或法律规定、法院判决的依据。

2. 登记手续：重新确定物权份额后，当事人需要按照法律规定办理相应的登记手续，以确保物权的合法性和有效性。

我建议：如果面临物权份额重新确定的问题，应首先咨询专业律师，了解具体的法律规定和操作流程。同时，注意保留相关证据材料，以便在需要时提供证明。如有进一步需要，您可以继续咨询我。