借条超过时效后有过协商还款，时效仍然算数。以下是详细分析：

一. 时效重新计算

• 法律依据：虽然具体的法律条文可能因地区而异，但普遍原则是，当借条超过诉讼时效后，如果债权人与债务人之间有过协商还款的行为，这被视为债务人对原债务的重新确认。
• 解释说明：在这种情况下，诉讼时效会从新的还款协议约定的履行期限届满之日起重新计算。例如，如果原欠款的诉讼时效已经届满，但双方达成了新的还款协议并约定在半年后还款，那么诉讼时效就会从半年后开始重新计算。

二. 时效抗辩权

• 法律依据：即使债权超过了诉讼时效，债权人仍然有权向法院起诉。但此时，债务人获得了诉讼时效抗辩权。
• 解释说明：如果债务人提出诉讼时效抗辩，并且法院经审理认为抗辩事由成立，法院可能会判决驳回债权人的诉讼请求。然而，如果债务人自愿履行债务，债权人仍然有权接受，并且债务人在履行后不得再以诉讼时效已过为由要求返还。

综上所述，借条超过时效后有过协商还款，时效是重新计算的。这意味着，如果双方达成了新的还款协议，债权人仍然有权在协议约定的履行期限届满后，向债务人主张债权。如有进一步需要，您可以继续咨询我。