结论前置：改制医院倒闭后，在编人员的处理方式需结合医院性质、改制协议及法律规定综合判断，具体有以下几种情况：

1. 若医院为事业单位改制为企业，倒闭后按《劳动合同法》处理

• 经济补偿：根据《劳动合同法》第44条、46条，医院因破产或经营困难终止劳动合同的，需向员工支付经济补偿金（按工作年限，每满1年支付1个月工资）。
• 社保衔接：医院应为员工办理社保关系转移手续，确保医保、养老等权益不受影响。若医院未缴纳社保，员工可向劳动监察部门投诉或申请仲裁。
• 特殊岗位保护：对医疗、护理等关键岗位人员，若医院未提前30日通知终止合同，需额外支付1个月工资作为代通知金。

2. 若医院改制时签订了“保留编制”协议，需按协议执行

• 协议优先：部分医院改制时可能与员工约定“保留事业编制至退休”或“转至其他公立机构”。若医院倒闭，员工可要求主管部门（如卫健委）履行协议，安排至其他公立医院工作。
• 协议无效情形：若协议违反法律强制性规定（如未通过职工代表大会审议），员工可主张协议无效，要求按《劳动合同法》获得补偿。

3. 若医院涉及国有资产，需按《企业国有资产法》处理

• 资产清算优先：医院倒闭后，国有资产应优先用于清偿员工工资、社保、经济补偿等债务。若资产不足，员工可申请参与破产分配。
• 主管部门责任：若医院为国有独资或控股，其上级主管部门（如国资委）可能需承担连带责任，员工可要求主管部门协调解决编制或补偿问题。

4. 员工可主张的救济途径

• 劳动仲裁：对医院未支付补偿、未缴纳社保等行为，员工可在1年内向劳动仲裁委申请仲裁，要求医院或其上级单位承担责任。
• 行政投诉：向当地卫健委、人社局投诉医院违规行为，要求行政部门介入调查并督促解决。
• 诉讼程序：若仲裁或行政途径未果，员工可向法院起诉，主张经济补偿、社保赔偿等权益。

5. 实务建议

• 固定证据：保留劳动合同、工资条、社保记录、改制协议等材料，作为维权依据。
• 集体协商：若涉及多人，可推选代表与医院或主管部门协商，提高解决效率。
• 关注政策：部分地区对改制医院员工有专项安置政策（如“编内转编外”过渡期），需及时向人社局了解。

总结：改制医院倒闭后，在编人员的处理需结合医院性质、改制协议及法律规定综合判断。建议优先通过协商、行政投诉解决，若未果可依法申请仲裁或诉讼。如有具体问题，可直接向我咨询，我会结合您的实际情况提供详细方案。