针对您提出的“银行过渡客户资金时，银行是否需要与第三人签订协议”的问题，我们可以从《中国银监会、中国人民银行关于加强商业银行与第三方支付机构合作业务管理的通知》这一规范性文件中找到相关依据。

首先，该通知明确指出了商业银行在与第三方支付机构合作开展业务时，需要遵循的一系列规定和要求，这些规定和要求旨在保护客户信息安全、保障客户资金和银行账户安全，以及维护客户合法权益。其中，与您问题直接相关的是关于商业银行与第三方支付机构建立业务关联时的具体要求。

根据通知内容，当客户银行账户与第三方支付机构首次建立业务关联时，银行应通过物理网点、电子渠道或其他有效方式直接验证客户身份，并明确双方权利与义务。这一过程中，虽然通知并未直接提及“签订协议”，但明确双方权利与义务的行为，在实际操作中往往通过签订协议或合同的形式来实现。这是因为协议或合同是明确双方权利和义务、规范双方行为的重要法律文件。

进一步地，通知中还提到了商业银行在与第三方支付机构签订业务合作协议时，应就非商业银行直接进行客户身份认证的批量扣款或电子支付等事项，与第三方支付机构就赔付责任达成一致。这再次强调了签订协议在商业银行与第三方支付机构合作中的重要性。

综合以上分析，我们可以得出结论：在银行过渡客户资金，特别是与第三方支付机构进行合作时，银行通常需要与第三方支付机构（即您问题中的“第三人”）签订协议，以明确双方的权利和义务，确保客户资金的安全和合规操作。这样的协议不仅有助于保护客户的合法权益，也是银行和第三方支付机构规范业务操作、防范风险的重要手段。