核心结论：父亲犯包庇罪，其处理方式主要依据我国《刑法》的相关规定，与孩子是否当兵无直接关联，但可能因家庭特殊情况在量刑时有所考量。以下是具体分析：

1. 包庇罪的认定与处罚：

   • 根据《中华人民共和国刑法》第三百一十条，明知是犯罪的人而为其提供隐藏处所、财物，帮助其逃匿或者作假证明包庇的，构成包庇罪。
   • 处罚上，一般处三年以下有期徒刑、拘役或者管制；情节严重的，处三年以上十年以下有期徒刑。这里的“情节严重”，通常指包庇的对象是严重犯罪分子、包庇行为给司法机关的侦查活动造成严重阻碍等。

2. 孩子当兵与父亲包庇罪的关系：

   • 孩子已经当兵这一事实，并不直接影响父亲包庇罪的认定与处罚。法律上，每个人的刑事责任都是独立的，不会因家庭成员的身份或职业而改变。
   • 然而，在量刑时，法院可能会考虑家庭特殊情况，如父亲的行为是否对孩子造成了不良影响，或者孩子是否因父亲的行为而面临特殊的社会压力等，但这些因素通常不是决定性的。

3. 可能的法律后果与应对：

   • 父亲一旦被认定犯有包庇罪，将面临刑事处罚，包括有期徒刑、拘役或管制等。
   • 对于家庭而言，应积极配合司法机关的调查，如实陈述事实，避免进一步的行为不当。同时，可以考虑寻求专业法律帮助，以更好地维护家庭成员的合法权益。

4. 特殊情况下的考量：

   • 如果父亲的行为是出于对孩子的保护或误解，且情节较轻，法院在量刑时可能会酌情从轻或减轻处罚。
   • 但无论如何，包庇犯罪行为都是违法的，不应因任何原因而得到纵容或鼓励。

建议：若您或您的家人面临此类法律问题，建议及时咨询并向我详细陈述情况，以便获得更具体、更专业的法律建议。