合同中约定债务人清偿债务完毕为合同终止，这一约定并不影响诉讼时效的计算。以下从不同角度为您详细分析：
一、诉讼时效的法定性
诉讼时效是法律规定的，请求法院保护民事权利的期间。根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，诉讼时效期间自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算，且诉讼时效的期间、计算方法以及中止、中断的事由由法律规定，当事人约定无效。这意味着，诉讼时效的计算不受当事人之间合同约定的影响。
二、合同终止与诉讼时效的关系
合同终止不改变诉讼时效的起算点： 即使合同中约定了债务人清偿债务完毕为合同终止，这一约定也仅是对合同效力终止条件的约定，并不改变诉讼时效的起算点。诉讼时效仍然是从权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。
合同终止不影响诉讼时效的继续计算： 合同终止后，如果权利人的权利受到损害且未超过诉讼时效期间，权利人仍然有权向法院提起诉讼，要求义务人履行义务或承担赔偿责任。此时，诉讼时效的继续计算不受合同终止的影响。
三、实际案例中的运用
在实际案例中，即使合同中明确约定了债务人清偿债务完毕为合同终止，当债务人未按照约定履行债务时，债权人仍然可以在诉讼时效期间内提起诉讼，要求债务人履行债务或承担违约责任。法院在审理此类案件时，会依据法律规定和案件事实，判断诉讼时效是否已过，而不会受合同中关于合同终止约定的影响。
四、建议与风险提示
明确合同条款： 在签订合同时，建议双方明确约定债务履行期限、违约责任以及诉讼时效等相关条款，以避免因约定不明而产生的纠纷。
及时行使权利： 作为权利人，应当及时行使自己的权利，避免因超过诉讼时效期间而丧失胜诉权。如果发现自己的权利受到损害，应当尽快采取法律措施维护自己的权益。
咨询专业律师： 在涉及合同纠纷、债务债权等法律问题时，建议咨询专业律师的意见。作为专业律师，我可以为您提供全面的法律分析和建议，帮助您更好地维护自己的合法权益。
综上所述，合同中约定债务人清偿债务完毕为合同终止，并不影响诉讼时效的计算。在处理此类法律问题时，应当依据法律规定和案件事实进行判断和决策。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。